NFX1

NFX1
Ідентифікатори
Символи	NFX1, NFX2, TEG-42, Tex42, nuclear transcription factor, X-box binding 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603255 MGI: 1921414 HomoloGene: 1875 GeneCards: NFX1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • zinc ion binding • ligase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • inflammatory response • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of MHC class II biosynthetic process • transcription, DNA-templated • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4799	74164
Ensembl	ENSG00000086102	ENSMUSG00000028423
UniProt	Q12986	B1AY10
RefSeq (мРНК)	NM_002504 NM_147133 NM_147134 NM_001318758	NM_001290448 NM_001290449 NM_023739
RefSeq (білок)	NP_001305687 NP_002495 NP_667345	NP_001277377 NP_001277378 NP_076228
Локус (UCSC)	Хр. 9: 33.29 – 33.37 Mb	Хр. 4: 40.97 – 41.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFX1 (англ. Nuclear transcription factor, X-box binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 120 амінокислот, а молекулярна маса — 124 395.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAPPVSGT		FKFNTDAAEF		IPQEKKNSGL		NCGTQRRLDS		NRIGRRNYSS
PPPCHLSRQV		PYDEISAVHQ		HSYHPSGSKP		KSQQTSFQSS		PCNKSPKSHG
LQNQPWQKLR		NEKHHIRVKK		AQSLAEQTSD		TAGLESSTRS		ESGTDLREHS
PSESEKEVVG		ADPRGAKPKK		ATQFVYSYGR		GPKVKGKLKC		EWSNRTTPKP
EDAGPESTKP		VGVFHPDSSE		ASSRKGVLDG		YGARRNEQRR		YPQKRPPWEV
EGARPRPGRN		PPKQEGHRHT		NAGHRNNMGP		IPKDDLNERP		AKSTCDSENL
AVINKSSRRV		DQEKCTVRRQ		DPQVVSPFSR		GKQNHVLKNV		ETHTGSLIEQ
LTTEKYECMV		CCELVRVTAP		VWSCQSCYHV		FHLNCIKKWA		RSPASQADGQ
SGWRCPACQN		VSAHVPNTYT		CFCGKVKNPE		WSRNEIPHSC		GEVCRKKQPG
QDCPHSCNLL		CHPGPCPPCP		AFMTKTCECG		RTRHTVRCGQ		AVSVHCSNPC
ENILNCGQHQ		CAELCHGGQC		QPCQIILNQV		CYCGSTSRDV		LCGTDVGKSD
GFGDFSCLKI		CGKDLKCGNH		TCSQVCHPQP		CQQCPRLPQL		VRCCPCGQTP
LSQLLELGSS		SRKTCMDPVP		SCGKVCGKPL		PCGSLDFIHT		CEKLCHEGDC
GPCSRTSVIS		CRCSFRTKEL		PCTSLKSEDA		TFMCDKRCNK		KRLCGRHKCN
EICCVDKEHK		CPLICGRKLR		CGLHRCEEPC		HRGNCQTCWQ		ASFDELTCHC
GASVIYPPVP		CGTRPPECTQ		TCARVHECDH		PVYHSCHSEE		KCPPCTFLTQ
KWCMGKHEFR		SNIPCHLVDI		SCGLPCSATL		PCGMHKCQRL		CHKGECLVDE
PCKQPCTTPR		ADCGHPCMAP		CHTSSPCPVT		ACKAKVELQC		ECGRRKEMVI
CSEASSTYQR		IAAISMASKI		TDMQLGGSVE		ISKLITKKEV		HQARLECDEE
CSALERKKRL		AEAFHISEDS		DPFNIRSSGS		KFSDSLKEDA		RKDLKFVSDV
EKEMETLVEA		VNKGKNSKKS		HSFPPMNRDH		RRIIHDLAQV		YGLESVSYDS
EPKRNVVVTA		IRGKSVCPPT		TLTGVLEREM		QARPPPPIPH		HRHQSDKNPG
SSNLQKITKE		PIIDYFDVQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, лігаз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Song Z., Krishna S., Thanos D., Strominger J.L., Ono S.J. (1994). A novel cysteine-rich sequence-specific DNA-binding protein interacts with the conserved X-box motif of the human major histocompatibility complex class II genes via a repeated Cys-His domain and functions as a transcriptional repressor. J. Exp. Med. 180: 1763—1774. PMID 7964459 DOI:10.1084/jem.180.5.1763
• Gewin L., Myers H., Kiyono T., Galloway D.A. (2004). Identification of a novel telomerase repressor that interacts with the human papillomavirus type-16 E6/E6-AP complex. Genes Dev. 18: 2269—2282. PMID 15371341 DOI:10.1101/gad.1214704

Див. також

• Хромосома 9