NKAP

NKAP
Ідентифікатори
Символи	NKAP, NFKB activating protein, MRXSHD
Зовнішні ІД	OMIM: 300766 MGI: 1914300 HomoloGene: 134325 GeneCards: NKAP
Онтологія гена Молекулярна функція • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • chromatin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • stem cell population maintenance • hematopoietic stem cell proliferation • кровотворення • granulocyte differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • T cell differentiation in thymus • positive regulation of alpha-beta T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79576	67050
Ensembl	ENSG00000101882	ENSMUSG00000016409
UniProt	Q8N5F7	Q9D0F4
RefSeq (мРНК)	NM_024528	NM_025937
RefSeq (білок)	NP_078804	NP_080213
Локус (UCSC)	Хр. X: 119.92 – 119.94 Mb	Хр. X: 36.39 – 36.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NKAP (англ. NFKB activating protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот, а молекулярна маса — 47 138.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPVSGSRSP		DREASGSGGR		RRSSSKSPKP		SKSARSPRGR		RSRSHSCSRS
GDRNGLTHQL		GGLSQGSRNQ		SYRSRSRSRS		RERPSAPRGI		PFASASSSVY
YGSYSRPYGS		DKPWPSLLDK		EREESLRQKR		LSERERIGEL		GAPEVWGLSP
KNPEPDSDEH		TPVEDEEPKK		STTSASTSEE		EKKKKSSRSK		ERSKKRRKKK
SSKRKHKKYS		EDSDSDSDSE		TDSSDEDNKR		RAKKAKKKEK		KKKHRSKKYK
KKRSKKSRKE		SSDSSSKESQ		EEFLENPWKD		RTKAEEPSDL		IGPEAPKTLT
SQDDKPLNYG		HALLPGEGAA		MAEYVKAGKR		IPRRGEIGLT		SEEIASFECS
GYVMSGSRHR		RMEAVRLRKE		NQIYSADEKR		ALASFNQEER		RKRENKILAS
FREMVYRKTK		GKDDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pajerowski A.G., Nguyen C., Aghajanian H., Shapiro M.J., Shapiro V.S. (2009). NKAP is a transcriptional repressor of notch signaling and is required for T cell development. Immunity. 30: 696—707. PMID 19409814 DOI:10.1016/j.immuni.2009.02.011

Див. також

• Хромосома X