NONO

NONO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SDE
Ідентифікатори
Символи	NONO, NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, non-POU domain containing, octamer-binding, non-POU domain containing octamer binding
Зовнішні ІД	OMIM: 300084 MGI: 1855692 HomoloGene: 7212 GeneCards: NONO
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic X-linked intellectual disability 34
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • paraspeckles • nuclear speck • мембрана • nuclear matrix • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • ядерце • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • mRNA processing • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of circadian rhythm • циркадний ритм • Сплайсинг РНК • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0100026 Репарація ДНК • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4841	53610
Ensembl	ENSG00000147140	ENSMUSG00000031311
UniProt	Q15233	Q99K48
RefSeq (мРНК)	NM_007363 NM_001145408 NM_001145409 NM_001145410	NM_001252518 NM_023144
RefSeq (білок)	NP_001138880 NP_001138881 NP_001138882 NP_031389	NP_001239447 NP_075633
Локус (UCSC)	Хр. X: 71.25 – 71.3 Mb	Хр. X: 100.47 – 100.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NONO (англ. Non-POU domain containing, octamer-binding) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 54 232.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSNKTFNLE		KQNHTPRKHH		QHHHQQQHHQ		QQQQQPPPPP		IPANGQQASS
QNEGLTIDLK		NFRKPGEKTF		TQRSRLFVGN		LPPDITEEEM		RKLFEKYGKA
GEVFIHKDKG		FGFIRLETRT		LAEIAKVELD		NMPLRGKQLR		VRFACHSASL
TVRNLPQYVS		NELLEEAFSV		FGQVERAVVI		VDDRGRPSGK		GIVEFSGKPA
ARKALDRCSE		GSFLLTTFPR		PVTVEPMDQL		DDEEGLPEKL		VIKNQQFHKE
REQPPRFAQP		GSFEYEYAMR		WKALIEMEKQ		QQDQVDRNIK		EAREKLEMEM
EAARHEHQVM		LMRQDLMRRQ		EELRRMEELH		NQEVQKRKQL		ELRQEEERRR
REEEMRRQQE		EMMRRQQEGF		KGTFPDAREQ		EIRMGQMAMG		GAMGINNRGA
MPPAPVPAGT		PAPPGPATMM		PDGTLGLTPP		TTERFGQAAT		MEGIGAIGGT
PPAFNRAAPG		AEFAPNKRRR		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, біологічні ритми, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Dong B., Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1993). Purification and cDNA cloning of HeLa cell p54nrb, a nuclear protein with two RNA recognition motifs and extensive homology to human splicing factor PSF and Drosophila NONA/BJ6. Nucleic Acids Res. 21: 4085—4092. PMID 8371983 DOI:10.1093/nar/21.17.4085
• Peters U., Haberhausen G., Kostrzewa M., Nolte D., Mueller U. (1997). AFX1 and p54nrb: fine mapping, genomic structure, and exclusion as candidate genes of X-linked dystonia parkinsonism. Hum. Genet. 100: 569—572. PMID 9341872 DOI:10.1007/s004390050553
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang W.-W., Zhang L.-X., Busch R.K., Farres J., Busch H. (1993). Purification and characterization of a DNA-binding heterodimer of 52 and 100 kDa from HeLa cells. Biochem. J. 290: 267—272. PMID 8439294 DOI:10.1042/bj2900267
• Straub T., Knudsen B.R., Boege F. (2000). PSF/p54(nrb) stimulates 'jumping' of DNA topoisomerase I between separate DNA helices. Biochemistry. 39: 7552—7558. PMID 10858305 DOI:10.1021/bi992898e
• Zhang Z., Carmichael G.G. (2001). The fate of dsRNA in the nucleus: a p54(nrb)-containing complex mediates the nuclear retention of promiscuously A-to-I edited RNAs. Cell. 106: 465—475. PMID 11525732 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00466-4

Див. також

• Хромосома X