PAXIP1

PAXIP1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SQD
Ідентифікатори
Символи	PAXIP1, CAGF29, PACIP1, PAXIP1L, PTIP, TNRC2, CAGF28, PAX interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608254 HomoloGene: 133914 GeneCards: PAXIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • nuclear matrix • нуклеоплазма • MLL3/4 complex • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • хромосома Біологічний процес • response to ionizing radiation • positive regulation of histone H3-K36 methylation • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chorion development • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • transcription, DNA-templated • positive regulation of histone acetylation • cellular response to DNA damage stimulus • васкулогенез • positive regulation of isotype switching • histone H3-K4 methylation • positive regulation of histone H3-K4 methylation • adipose tissue development • double-strand break repair via nonhomologous end joining • positive regulation of protein ubiquitination • endothelial cell migration • GO:0100026 Репарація ДНК • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of cell cycle G2/M phase transition • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • positive regulation of response to DNA damage stimulus • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22976	449658
Ensembl	ENSG00000157212	ENSDARG00000005606
UniProt	Q6ZW49	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_007349	NM_001005929
RefSeq (білок)	NP_031375	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 154.94 – 155 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PAXIP1 (англ. PAX interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 121 341.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDQAPKVPE		EMFREVKYYA		VGDIDPQVIQ		LLKAGKAKEV		SYNALASHII
SEDGDNPEVG		EAREVFDLPV		VKPSWVILSV		QCGTLLPVNG		FSPESCQIFF
GITACLSQVS		SEDRSALWAL		VTFYGGDCQL		TLNKKCTHLI		VPEPKGEKYE
CALKRASIKI		VTPDWVLDCV		SEKTKKDEAF		YHPRLIIYEE		EEEEEEEEEE
VENEEQDSQN		EGSTDEKSSP		ASSQEGSPSG		DQQFSPKSNT		EKSKGELMFD
DSSDSSPEKQ		ERNLNWTPAE		VPQLAAAKRR		LPQGKEPGLI		NLCANVPPVP
GNILPPEVRG		NLMAAGQNLQ		SSERSEMIAT		WSPAVRTLRN		ITNNADIQQM
NRPSNVAHIL		QTLSAPTKNL		EQQVNHSQQG		HTNANAVLFS		QVKVTPETHM
LQQQQQAQQQ		QQQHPVLHLQ		PQQIMQLQQQ		QQQQISQQPY		PQQPPHPFSQ
QQQQQQQAHP		HQFSQQQLQF		PQQQLHPPQQ		LHRPQQQLQP		FQQQHALQQQ
FHQLQQHQLQ		QQQLAQLQQQ		HSLLQQQQQQ		QIQQQQLQRM		HQQQQQQQMQ
SQTAPHLSQT		SQALQHQVPP		QQPPQQQQQQ		QPPPSPQQHQ		LFGHDPAVEI
PEEGFLLGCV		FAIADYPEQM		SDKQLLATWK		RIIQAHGGTV		DPTFTSRCTH
LLCESQVSSA		YAQAIRERKR		CVTAHWLNTV		LKKKKMVPPH		RALHFPVAFP
PGGKPCSQHI		ISVTGFVDSD		RDDLKLMAYL		AGAKYTGYLC		RSNTVLICKE
PTGLKYEKAK		EWRIPCVNAQ		WLGDILLGNF		EALRQIQYSR		YTAFSLQDPF
APTQHLVLNL		LDAWRVPLKV		SAELLMSIRL		PPKLKQNEVA		NVQPSSKRAR
IEDVPPPTKK		LTPELTPFVL		FTGFEPVQVQ		QYIKKLYILG		GEVAESAQKC
THLIASKVTR		TVKFLTAISV		VKHIVTPEWL		EECFRCQKFI		DEQNYILRDA
EAEVLFSFSL		EESLKRAHVS		PLFKAKYFYI		TPGICPSLST		MKAIVECAGG
KVLSKQPSFR		KLMEHKQNSS		LSEIILISCE		NDLHLCREYF		ARGIDVHNAE
FVLTGVLTQT		LDYESYKFN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Manke I.A., Lowery D.M., Nguyen A., Yaffe M.B. (2003). BRCT repeats as phosphopeptide-binding modules involved in protein targeting. Science. 302: 636—639. PMID 14576432 DOI:10.1126/science.1088877
• Jowsey P.A., Doherty A.J., Rouse J. (2004). Human PTIP facilitates ATM-mediated activation of p53 and promotes cellular resistance to ionizing radiation. J. Biol. Chem. 279: 55562—55569. PMID 15456759 DOI:10.1074/jbc.M411021200
• Patel S.R., Kim D., Levitan I., Dressler G.R. (2007). The BRCT-domain containing protein PTIP links PAX2 to a histone H3, lysine 4 methyltransferase complex. Dev. Cell. 13: 580—592. PMID 17925232 DOI:10.1016/j.devcel.2007.09.004
• Munoz I.M., Jowsey P.A., Toth R., Rouse J. (2007). Phospho-epitope binding by the BRCT domains of hPTIP controls multiple aspects of the cellular response to DNA damage. Nucleic Acids Res. 35: 5312—5322. PMID 17690115 DOI:10.1093/nar/gkm493
• Gohler T., Munoz I.M., Rouse J., Blow J.J. (2008). PTIP/Swift is required for efficient PCNA ubiquitination in response to DNA damage. DNA Repair. 7: 775—787. PMID 18353733 DOI:10.1016/j.dnarep.2008.02.001

Див. також

• Хромосома 7