PIF1

PIF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5FHH
Ідентифікатори
Символи	PIF1, C15orf20, PIF, PIF1 5'-to-3' DNA helicase
Зовнішні ІД	OMIM: 610953 MGI: 2143057 HomoloGene: 99775 GeneCards: PIF1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • GO:0033682 5'-3' DNA/RNA helicase activity • hydrolase activity • ATP binding • magnesium ion binding • telomerase inhibitor activity • GO:0043141 5'-3' DNA helicase activity • G-quadruplex DNA binding Клітинна компонента • replication fork • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • DNA recombination • regulation of telomere maintenance • negative regulation of telomerase activity • G-quadruplex DNA unwinding • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding • mitochondrial genome maintenance • реплікація ДНК • negative regulation of telomere maintenance via telomerase Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80119	208084
Ensembl	ENSG00000140451	ENSMUSG00000041064
UniProt	Q9H611	Q80SX8
RefSeq (мРНК)	NM_001286496 NM_001286497 NM_001286499 NM_025049	NM_172453 NM_001357526 NM_001357527
RefSeq (білок)	NP_001273425 NP_001273426 NP_001273428 NP_079325	NP_766041 NP_001344455 NP_001344456
Локус (UCSC)	Хр. 15: 64.82 – 64.83 Mb	Хр. 9: 65.59 – 65.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PIF1 (англ. PIF1 5'-to-3' DNA helicase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 641 амінокислот, а молекулярна маса — 69 799.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSGIEAAAG		EYEDSELRCR		VAVEELSPGG		QPRRRQALRT		AELSLGRNER
RELMLRLQAP		GPAGRPRCFP		LRAARLFTRF		AEAGRSTLRL		PAHDTPGAGA
VQLLLSDCPP		DRLRRFLRTL		RLKLAAAPGP		GPASARAQLL		GPRPRDFVTI
SPVQPEERRL		RAATRVPDTT		LVKRPVEPQA		GAEPSTEAPR		WPLPVKRLSL
PSTKPQLSEE		QAAVLRAVLK		GQSIFFTGSA		GTGKSYLLKR		ILGSLPPTGT
VATASTGVAA		CHIGGTTLHA		FAGIGSGQAP		LAQCVALAQR		PGVRQGWLNC
QRLVIDEISM		VEADLFDKLE		AVARAVRQQN		KPFGGIQLII		CGDFLQLPPV
TKGSQPPRFC		FQSKSWKRCV		PVTLELTKVW		RQADQTFISL		LQAVRLGRCS
DEVTRQLQAT		ASHKVGRDGI		VATRLCTHQD		DVALTNERRL		QELPGKVHRF
EAMDSNPELA		STLDAQCPVS		QLLQLKLGAQ		VMLVKNLSVS		RGLVNGARGV
VVGFEAEGRG		LPQVRFLCGV		TEVIHADRWT		VQATGGQLLS		RQQLPLQLAW
AMSIHKSQGM		TLDCVEISLG		RVFASGQAYV		ALSRARSLQG		LRVLDFDPMA
VRCDPRVLHF		YATLRRGRSL		SLESPDDDEA		ASDQENMDPI		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

• Zhang D.-H., Zhou B., Huang Y., Xu L.-X., Zhou J.-Q. (2006). The human Pif1 helicase, a potential Escherichia coli RecD homologue, inhibits telomerase activity. Nucleic Acids Res. 34: 1393—1404. PMID 16522649 DOI:10.1093/nar/gkl029
• Gu Y., Masuda Y., Kamiya K. (2008). Biochemical analysis of human PIF1 helicase and functions of its N-terminal domain. Nucleic Acids Res. 36: 6295—6308. PMID 18835853 DOI:10.1093/nar/gkn609
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mateyak M.K., Zakian V.A. (2006). Human PIF helicase is cell cycle regulated and associates with telomerase. Cell Cycle. 5: 2796—2804. PMID 17172855 DOI:10.4161/cc.5.23.3524
• Futami K., Shimamoto A., Furuichi Y. (2007). Mitochondrial and nuclear localization of human Pif1 helicase. Biol. Pharm. Bull. 30: 1685—1692. PMID 17827721 DOI:10.1248/bpb.30.1685
• Sanders C.M. (2010). Human Pif1 helicase is a G-quadruplex DNA-binding protein with G-quadruplex DNA-unwinding activity. Biochem. J. 430: 119—128. PMID 20524933 DOI:10.1042/BJ20100612

Див. також

• Хромосома 15