POLR1A

POLR1A
Ідентифікатори
Символи	POLR1A, A190, RPA1, RPA194, RPO1-4, RPO14, AFDCIN, polymerase (RNA) I subunit A, RNA polymerase I subunit A, RPA190
Зовнішні ІД	OMIM: 616404 MGI: 1096397 HomoloGene: 7033 GeneCards: POLR1A
Пов'язані генетичні захворювання
acrofacial dysostosis Cincinnati type, choanal atresia-hearing loss-cardiac defects-craniofacial dysmorphism syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase I activity • chromatin binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • RNA polymerase I complex • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • negative regulation of protein localization to nucleolus • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25885	20019
Ensembl	ENSG00000068654	ENSMUSG00000049553
UniProt	O95602	O35134
RefSeq (мРНК)	NM_015425	NM_009088
RefSeq (білок)	NP_056240	NP_033114
Локус (UCSC)	Хр. 2: 86.02 – 86.11 Mb	Хр. 6: 71.89 – 71.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLR1A (англ. RNA polymerase I subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 720 амінокислот, а молекулярна маса — 194 811.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLISKNMPWR		RLQGISFGMY		SAEELKKLSV		KSITNPRYLD		SLGNPSANGL
YDLALGPADS		KEVCSTCVQD		FSNCSGHLGH		IELPLTVYNP		LLFDKLYLLL
RGSCLNCHML		TCPRAVIHLL		LCQLRVLEVG		ALQAVYELER		ILNRFLEENP
DPSASEIREE		LEQYTTEIVQ		NNLLGSQGAH		VKNVCESKSK		LIALFWKAHM
NAKRCPHCKT		GRSVVRKEHN		SKLTITFPAM		VHRTAGQKDS		EPLGIEEAQI
GKRGYLTPTS		AREHLSALWK		NEGFFLNYLF		SGMDDDGMES		RFNPSVFFLD
FLVVPPSRYR		PVSRLGDQMF		TNGQTVNLQA		VMKDVVLIRK		LLALMAQEQK
LPEEVATPTT		DEEKDSLIAI		DRSFLSTLPG		QSLIDKLYNI		WIRLQSHVNI
VFDSEMDKLM		MDKYPGIRQI		LEKKEGLFRK		HMMGKRVDYA		ARSVICPDMY
INTNEIGIPM		VFATKLTYPQ		PVTPWNVQEL		RQAVINGPNV		HPGASMVINE
DGSRTALSAV		DMTQREAVAK		QLLTPATGAP		KPQGTKIVCR		HVKNGDILLL
NRQPTLHRPS		IQAHRARILP		EEKVLRLHYA		NCKAYNADFD		GDEMNAHFPQ
SELGRAEAYV		LACTDQQYLV		PKDGQPLAGL		IQDHMVSGAS		MTTRGCFFTR
EHYMELVYRG		LTDKVGRVKL		LSPSILKPFP		LWTGKQVVST		LLINIIPEDH
IPLNLSGKAK		ITGKAWVKET		PRSVPGFNPD		SMCESQVIIR		EGELLCGVLD
KAHYGSSAYG		LVHCCYEIYG		GETSGKVLTC		LARLFTAYLQ		LYRGFTLGVE
DILVKPKADV		KRQRIIEEST		HCGPQAVRAA		LNLPEAASYD		EVRGKWQDAH
LGKDQRDFNM		IDLKFKEEVN		HYSNEINKAC		MPFGLHRQFP		ENSLQMMVQS
GAKGSTVNTM		QISCLLGQIE		LEGRRPPLMA		SGKSLPCFEP		YEFTPRAGGF
VTGRFLTGIK		PPEFFFHCMA		GREGLVDTAV		KTSRSGYLQR		CIIKHLEGLV
VQYDLTVRDS		DGSVVQFLYG		EDGLDIPKTQ		FLQPKQFPFL		ASNYEVIMKS
QHLHEVLSRA		DPKKALHHFR		AIKKWQSKHP		NTLLRRGAFL		SYSQKIQEAV
KALKLESENR		NGRSPGTQEM		LRMWYELDEE		SRRKYQKKAA		ACPDPSLSVW
RPDIYFASVS		ETFETKVDDY		SQEWAAQTEK		SYEKSELSLD		RLRTLLQLKW
QRSLCEPGEA		VGLLAAQSIG		EPSTQMTLNT		FHFAGRGEMN		VTLGIPRLRE
ILMVASANIK		TPMMSVPVLN		TKKALKRVKS		LKKQLTRVCL		GEVLQKIDVQ
ESFCMEEKQN		KFQVYQLRFQ		FLPHAYYQQE		KCLRPEDILR		FMETRFFKLL
MESIKKKNNK		ASAFRNVNTR		RATQRDLDNA		GELGRSRGEQ		EGDEEEEGHI
VDAEAEEGDA		DASDAKRKEK		QEEEVDYESE		EEEEREGEEN		DDEDMQEERN
PHREGARKTQ		EQDEEVGLGT		EEDPSLPALL		TQPRKPTHSQ		EPQGPEAMER
RVQAVREIHP		FIDDYQYDTE		ESLWCQVTVK		LPLMKINFDM		SSLVVSLAHG
AVIYATKGIT		RCLLNETTNN		KNEKELVLNT		EGINLPELFK		YAEVLDLRRL
YSNDIHAIAN		TYGIEAALRV		IEKEIKDVFA		VYGIAVDPRH		LSLVADYMCF
EGVYKPLNRF		GIRSNSSPLQ		QMTFETSFQF		LKQATMLGSH		DELRSPSACL
VVGKVVRGGT		GLFELKQPLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2