POLR3F

POLR3F
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DK5, 2YU3
Ідентифікатори
Символи	POLR3F, RPC39, RPC6, polymerase (RNA) III subunit F, RNA polymerase III subunit F, C34
Зовнішні ІД	OMIM: 617455 MGI: 1924086 HomoloGene: 4722 GeneCards: POLR3F
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III activity • double-stranded DNA binding • DNA binding Клітинна компонента • RNA polymerase III complex • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • positive regulation of interferon-beta production • процес імунної системи • defense response to virus • positive regulation of innate immune response • transcription by RNA polymerase III • вроджений імунітет • regulation of transcription by RNA polymerase III • positive regulation of type I interferon production Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10621	70408
Ensembl	ENSG00000132664	ENSMUSG00000027427
UniProt	Q9H1D9	Q921X6
RefSeq (мРНК)	NM_001282526 NM_006466	NM_029763 NM_027417
RefSeq (білок)	NP_001269455 NP_006457	NP_084039
Локус (UCSC)	Хр. 20: 18.47 – 18.48 Mb	Хр. 2: 144.37 – 144.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLR3F (англ. RNA polymerase III subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 316 амінокислот, а молекулярна маса — 35 684.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEVKVKVQP		PDADPVEIEN		RIIELCHQFP		HGITDQVIQN		EMPHIEAQQR
AVAINRLLSM		GQLDLLRSNT		GLLYRIKDSQ		NAGKMKGSDN		QEKLVYQIIE
DAGNKGIWSR		DIRYKSNLPL		TEINKILKNL		ESKKLIKAVK		SVAASKKKVY
MLYNLQPDRS		VTGGAWYSDQ		DFESEFVEVL		NQQCFKFLQS		KAETARESKQ
NPMIQRNSSF		ASSHEVWKYI		CELGISKVEL		SMEDIETILN		TLIYDGKVEM
TIIAAKEGTV		GSVDGHMKLY		RAVNPIIPPT		GLVRAPCGLC		PVFDDCHEGG
EISPSNCIYM		TEWLEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, противірусний захист, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang Z., Roeder R.G. (1997). Three human RNA polymerase III-specific subunits form a subcomplex with a selective function in specific transcription initiation. Genes Dev. 11: 1315—1326. PMID 9171375 DOI:10.1101/gad.11.10.1315
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hsieh Y.-J., Kundu T.K., Wang Z., Kovelman R., Roeder R.G. (1999). The TFIIIC90 subunit of TFIIIC interacts with multiple components of the RNA polymerase III machinery and contains a histone-specific acetyltransferase activity. Mol. Cell. Biol. 19: 7697—7704. PMID 10523658 DOI:10.1128/MCB.19.11.7697
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Chiu Y.-H., Macmillan J.B., Chen Z.J. (2009). RNA polymerase III detects cytosolic DNA and induces type I interferons through the RIG-I pathway. Cell. 138: 576—591. PMID 19631370 DOI:10.1016/j.cell.2009.06.015

Див. також

• Хромосома 20