PPP1R8

PPP1R8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3V4Y
Ідентифікатори
Символи	PPP1R8, ARD-1, ARD1, NIPP-1, NIPP1, PRO2047, protein phosphatase 1 regulatory subunit 8
Зовнішні ІД	OMIM: 602636 MGI: 2140494 HomoloGene: 8555 GeneCards: PPP1R8
Онтологія гена Молекулярна функція • protein serine/threonine phosphatase inhibitor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein phosphatase inhibitor activity • nuclease activity • endonuclease activity • ribonuclease E activity • hydrolase activity • mRNA binding • protein phosphatase regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • mRNA processing • Деградація РНК • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • проліферація • RNA phosphodiester bond hydrolysis • negative regulation of protein dephosphorylation • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity • regulation of phosphoprotein phosphatase activity • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5511	100336
Ensembl	ENSG00000117751	ENSMUSG00000028882
UniProt	Q12972	Q8R3G1
RefSeq (мРНК)	NM_138558 NM_002713 NM_014110	NM_001290725 NM_146154 NM_001355198 NM_001355199
RefSeq (білок)	NP_002704 NP_054829 NP_612568	NP_001277654 NP_666266 NP_001342127 NP_001342128
Локус (UCSC)	Хр. 1: 27.83 – 27.85 Mb	Хр. 4: 132.55 – 132.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPP1R8 (англ. Protein phosphatase 1 regulatory subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 479.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAANSGSS		LPLFDCPTWA		GKPPPGLHLD		VVKGDKLIEK		LIIDEKKYYL
FGRNPDLCDF		TIDHQSCSRV		HAALVYHKHL		KRVFLIDLNS		THGTFLGHIR
LEPHKPQQIP		IDSTVSFGAS		TRAYTLREKP		QTLPSAVKGD		EKMGGEDDEL
KGLLGLPEEE		TELDNLTEFN		TAHNKRISTL		TIEEGNLDIQ		RPKRKRKNSR
VTFSEDDEII		NPEDVDPSVG		RFRNMVQTAV		VPVKKKRVEG		PGSLGLEESG
SRRMQNFAFS		GGLYGGLPPT		HSEAGSQPHG		IHGTALIGGL		PMPYPNLAPD
VDLTPVVPSA		VNMNPAPNPA		VYNPEAVNEP		KKKKYAKEAW		PGKKPTPSLL
I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wang M., Cohen S.N. (1994). ard-1: a human gene that reverses the effects of temperature-sensitive and deletion mutations in the Escherichia coli rne gene and encodes an activity producing RNase E-like cleavages. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 10591—10595. PMID 7524097 DOI:10.1073/pnas.91.22.10591
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Claverie-Martin F., Wang M., Cohen S.N. (1997). ARD-1 cDNA from human cells encodes a site-specific single-strand endoribonuclease that functionally resembles Escherichia coli RNase E. J. Biol. Chem. 272: 13823—13828. PMID 9153239 DOI:10.1074/jbc.272.21.13823
• Beullens M., Bollen M. (2002). The protein phosphatase-1 regulator NIPP1 is also a splicing factor involved in a late step of spliceosome assembly. J. Biol. Chem. 277: 19855—19860. PMID 11909864 DOI:10.1074/jbc.M200847200
• Boudrez A., Beullens M., Waelkens E., Stalmans W., Bollen M. (2002). Phosphorylation-dependent interaction between the splicing factors SAP155 and NIPP1. J. Biol. Chem. 277: 31834—31841. PMID 12105215 DOI:10.1074/jbc.M204427200
• Lee J.H., You J., Dobrota E., Skalnik D.G. (2010). Identification and characterization of a novel human PP1 phosphatase complex. J. Biol. Chem. 285: 24466—24476. PMID 20516061 DOI:10.1074/jbc.M110.109801

Див. також

• Хромосома 1