PTPRN

PTPRN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I1Y, 2QT7, 3N01, 3N4W, 3NG8, 3NP5
Ідентифікатори
Символи	PTPRN, IA-2, IA-2/PTP, IA2, ICA512, R-PTP-N, protein tyrosine phosphatase, receptor type N, protein tyrosine phosphatase receptor type N
Зовнішні ІД	OMIM: 601773 MGI: 102765 HomoloGene: 48142 GeneCards: PTPRN
Онтологія гена Молекулярна функція • spectrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transcription factor binding • ubiquitin-like protein ligase binding • GTPase binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • axon terminus • integral component of membrane • перикаріон • ендосома • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • Синаптичні бульбашки • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • синапс • secretory granule • аксон • міжклітинні контакти • neuronal cell body • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро Біологічний процес • luteinization • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0001315 response to reactive oxygen species • insulin secretion • response to glucose • response to estrogen • response to insulin • response to cAMP • dense core granule maturation • insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of type B pancreatic cell proliferation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0016576 protein dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5798	19275
Ensembl	ENSG00000054356	ENSMUSG00000026204
UniProt	Q16849	Q60673
RefSeq (мРНК)	NM_001199763 NM_001199764 NM_002846	NM_008985 NM_001359281
RefSeq (білок)	NP_001186692 NP_001186693 NP_002837	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 219.29 – 219.31 Mb	Хр. 1: 75.22 – 75.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRN (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type N) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 979 амінокислот, а молекулярна маса — 105 848.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRPRRPGGL		GGSGGLRLLL		CLLLLSSRPG		GCSAVSAHGC		LFDRRLCSHL
EVCIQDGLFG		QCQVGVGQAR		PLLQVTSPVL		QRLQGVLRQL		MSQGLSWHDD
LTQYVISQEM		ERIPRLRPPE		PRPRDRSGLA		PKRPGPAGEL		LLQDIPTGSA
PAAQHRLPQP		PVGKGGAGAS		SSLSPLQAEL		LPPLLEHLLL		PPQPPHPSLS
YEPALLQPYL		FHQFGSRDGS		RVSEGSPGMV		SVGPLPKAEA		PALFSRTASK
GIFGDHPGHS		YGDLPGPSPA		QLFQDSGLLY		LAQELPAPSR		ARVPRLPEQG
SSSRAEDSPE		GYEKEGLGDR		GEKPASPAVQ		PDAALQRLAA		VLAGYGVELR
QLTPEQLSTL		LTLLQLLPKG		AGRNPGGVVN		VGADIKKTME		GPVEGRDTAE
LPARTSPMPG		HPTASPTSSE		VQQVPSPVSS		EPPKAARPPV		TPVLLEKKSP
LGQSQPTVAG		QPSARPAAEE		YGYIVTDQKP		LSLAAGVKLL		EILAEHVHMS
SGSFINISVV		GPALTFRIRH		NEQNLSLADV		TQQAGLVKSE		LEAQTGLQIL
QTGVGQREEA		AAVLPQTAHS		TSPMRSVLLT		LVALAGVAGL		LVALAVALCV
RQHARQQDKE		RLAALGPEGA		HGDTTFEYQD		LCRQHMATKS		LFNRAEGPPE
PSRVSSVSSQ		FSDAAQASPS		SHSSTPSWCE		EPAQANMDIS		TGHMILAYME
DHLRNRDRLA		KEWQALCAYQ		AEPNTCATAQ		GEGNIKKNRH		PDFLPYDHAR
IKLKVESSPS		RSDYINASPI		IEHDPRMPAY		IATQGPLSHT		IADFWQMVWE
SGCTVIVMLT		PLVEDGVKQC		DRYWPDEGAS		LYHVYEVNLV		SEHIWCEDFL
VRSFYLKNVQ		TQETRTLTQF		HFLSWPAEGT		PASTRPLLDF		RRKVNKCYRG
RSCPIIVHCS		DGAGRTGTYI		LIDMVLNRMA		KGVKEIDIAA		TLEHVRDQRP
GLVRSKDQFE		FALTAVAEEV		NAILKALPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

• Lan M.S., Lu J., Goto Y., Notkins A.L. (1994). Molecular cloning and identification of a receptor-type protein tyrosine phosphatase, IA-2, from human insulinoma. DNA Cell Biol. 13: 505—514. PMID 8024693 DOI:10.1089/dna.1994.13.505
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hermel J.-M., Dirkx R., Solimena M. (1999). Post-translational modifications of ICA512, a receptor tyrosine phosphatase-like protein of secretory granules. Eur. J. Neurosci. 11: 2609—2620. PMID 10457160 DOI:10.1046/j.1460-9568.1999.00677.x
• Hu Y.F., Zhang H.L., Cai T., Harashima S., Notkins A.L. (2005). The IA-2 interactome. Diabetologia. 48: 2576—2581. PMID 16273344 DOI:10.1007/s00125-005-0037-y
• Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 2