RBBP7

RBBP7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3CFS, 3CFV
Ідентифікатори
Символи	RBBP7, RbAp46, retinoblastoma binding protein 7, RB binding protein 7, chromatin remodeling factor
Зовнішні ІД	OMIM: 300825 MGI: 1194910 HomoloGene: 55702 GeneCards: RBBP7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • histone deacetylase activity Клітинна компонента • NuRD complex • ESC/E(Z) complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to steroid hormone • cellular heat acclimation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • Реплікація ДНК • negative regulation of gene expression, epigenetic • negative regulation of cell growth • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone deacetylation • посттрансляційна модифікація • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5931	245688
Ensembl	ENSG00000102054	ENSMUSG00000031353
UniProt	Q16576	Q60973
RefSeq (мРНК)	NM_001198719 NM_002893	NM_009031
RefSeq (білок)	NP_001185648 NP_002884	NP_033057
Локус (UCSC)	Хр. X: 16.84 – 16.87 Mb	Хр. X: 161.54 – 161.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBBP7 (англ. RB binding protein 7, chromatin remodeling factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASKEMFEDT		VEERVINEEY		KIWKKNTPFL		YDLVMTHALQ		WPSLTVQWLP
EVTKPEGKDY		ALHWLVLGTH		TSDEQNHLVV		ARVHIPNDDA		QFDASHCDSD
KGEFGGFGSV		TGKIECEIKI		NHEGEVNRAR		YMPQNPHIIA		TKTPSSDVLV
FDYTKHPAKP		DPSGECNPDL		RLRGHQKEGY		GLSWNSNLSG		HLLSASDDHT
VCLWDINAGP		KEGKIVDAKA		IFTGHSAVVE		DVAWHLLHES		LFGSVADDQK
LMIWDTRSNT		TSKPSHLVDA		HTAEVNCLSF		NPYSEFILAT		GSADKTVALW
DLRNLKLKLH		TFESHKDEIF		QVHWSPHNET		ILASSGTDRR		LNVWDLSKIG
EEQSAEDAED		GPPELLFIHG		GHTAKISDFS		WNPNEPWVIC		SVSEDNIMQI
WQMAENIYND		EESDVTTSEL		EGQGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Qian Y.-W., Lee E.Y.-H.P. (1995). Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast. J. Biol. Chem. 270: 25507—25513. PMID 7503932 DOI:10.1074/jbc.270.43.25507
• Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (1997). Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. Cell. 89: 357—364. PMID 9150135 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80216-0
• Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.-P., Lane W.S., Reinberg D. (1998). The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. Cell. 95: 279—289. PMID 9790534 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4
• Verreault A., Kaufman P.D., Kobayashi R., Stillman B. (1998). Nucleosomal DNA regulates the core-histone-binding subunit of the human Hat1 acetyltransferase. Curr. Biol. 8: 96—108. PMID 9427644 DOI:10.1016/S0960-9822(98)70040-5
• Yarden R.I., Brody L.C. (1999). BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4983—4988. PMID 10220405 DOI:10.1073/pnas.96.9.4983
• Zhang Q., Vo N., Goodman R.H. (2000). Histone binding protein RbAp48 interacts with a complex of CREB binding protein and phosphorylated CREB. Mol. Cell. Biol. 20: 4970—4978. PMID 10866654 DOI:10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000

Див. також

• Хромосома X