RBM38

RBM38
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CQD
Ідентифікатори
Символи	RBM38, HSRNASEB, RNPC1, SEB4B, SEB4D, dJ800J21.2, RNA binding motif protein 38
Зовнішні ІД	OMIM: 612428 MGI: 1889294 HomoloGene: 79543 GeneCards: RBM38
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • mRNA 3'-UTR binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • клітинний цикл • regulation of myotube differentiation • mRNA processing • диференціація клітин • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • regulation of RNA splicing • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization • Сплайсинг РНК • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • negative regulation of cell population proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55544	56190
Ensembl	ENSG00000132819	ENSMUSG00000027510
UniProt	Q9H0Z9	Q62176
RefSeq (мРНК)	NM_001291780 NM_017495 NM_183425	NM_019547
RefSeq (білок)	NP_001278709 NP_059965 NP_906270	NP_062420
Локус (UCSC)	Хр. 20: 57.39 – 57.41 Mb	Хр. 2: 172.86 – 172.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM38 (англ. RNA binding motif protein 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 239 амінокислот, а молекулярна маса — 25 498.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLQPAPCAP		SAGFPRPLAA		PGAMHGSQKD		TTFTKIFVGG		LPYHTTDASL
RKYFEGFGDI		EEAVVITDRQ		TGKSRGYGFV		TMADRAAAER		ACKDPNPIID
GRKANVNLAY		LGAKPRSLQT		GFAIGVQQLH		PTLIQRTYGL		TPHYIYPPAI
VQPSVVIPAA		PVPSLSSPYI		EYTPASPAYA		QYPPATYDQY		PYAASPATAA
SFVGYSYPAA		VPQALSAAAP		AGTTFVQYQA		PQLQPDRMQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, клітинний цикл, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shu L., Yan W., Chen X. (2006). RNPC1, an RNA-binding protein and a target of the p53 family, is required for maintaining the stability of the basal and stress-induced p21 transcript. Genes Dev. 20: 2961—2972. PMID 17050675 DOI:10.1101/gad.1463306
• Warzecha C.C., Sato T.K., Nabet B., Hogenesch J.B., Carstens R.P. (2009). ESRP1 and ESRP2 are epithelial cell-type-specific regulators of FGFR2 splicing. Mol. Cell. 33: 591—601. PMID 19285943 DOI:10.1016/j.molcel.2009.01.025

Див. також

• Хромосома 20