RBM4

RBM4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DNQ
Ідентифікатори
Символи	RBM4, LARK, RBM4A, ZCCHC21, ZCRB3A, RNA binding motif protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602571 MGI: 1100865 HomoloGene: 82510 GeneCards: RBM4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• pre-mRNA intronic pyrimidine-rich binding; • pre-mRNA intronic binding; • miRNA binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • mRNA 3'-UTR binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • mRNA binding; • cyclin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • nuclear speck; • нуклеоплазма; • ядерце; • cytoplasmic stress granule; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • regulation of nucleocytoplasmic transport; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • negative regulation of translation; • negative regulation of translation in response to stress; • negative regulation of translational initiation; • positive regulation of muscle cell differentiation; • mRNA processing; • response to arsenic-containing substance; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • cap-independent translational initiation; • circadian regulation of translation; • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation; • IRES-dependent translational initiation of linear mRNA; • Сплайсинг РНК; • Сайленсинг генів; • entrainment of circadian clock by photoperiod; • mRNA cis splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5936
	19653
	ENSG00000173933
	ENSMUSG00000094936
	Q9BWF3
	Q8C7Q4
	NM_002896; NM_001198843; NM_001198844
	NM_001290122; NM_001290123; NM_001290124; NM_001290125; NM_009032
	NP_001185772; NP_001185773; NP_002887
	NP_001277051; NP_001277052; NP_001277053; NP_001277054; NP_033058
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RBM4 (англ. RNA binding motif protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 40 314^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVKLFIGNLP	REATEQEIRS	LFEQYGKVLE	CDIIKNYGFV	HIEDKTAAED
AIRNLHHYKL	HGVNINVEAS	KNKSKTSTKL	HVGNISPTCT	NKELRAKFEE
YGPVIECDIV	KDYAFVHMER	AEDAVEAIRG	LDNTEFQGKR	MHVQLSTSRL
RTAPGMGDQS	GCYRCGKEGH	WSKECPIDRS	GRVADLTEQY	NEQYGAVRTP
YTMSYGDSLY	YNNAYGALDA	YYKRCRAARS	YEAVAAAAAS	VYNYAEQTLS
QLPQVQNTAM	ASHLTSTSLD	PYDRHLLPTS	GAAATAAAAA	AAAAAVTAAS
TSYYGRDRSP	LRRATAPVPT	VGEGYGYGHE	SELSQASAAA	RNSLYDMARY
EREQYADRAR	YSAF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Jackson F.R., Banfi S., Guffanti A., Rossi E. (1997). A novel zinc finger-containing RNA-binding protein conserved from fruitflies to humans. Genomics. 41: 444—452. PMID 9169144 DOI:10.1006/geno.1997.4704
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bernert G., Fountoulakis M., Lubec G. (2002). Manifold decreased protein levels of matrin 3, reduced motor protein HMP and hlark in fetal Down's syndrome brain. Proteomics. 2: 1752—1757. PMID 12469345 DOI:10.1002/1615-9861(200212)2:12<1752::AID-PROT1752>3.0.CO;2-Y
Lai M.-C., Kuo H.-W., Chang W.-C., Tarn W.-Y. (2003). A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins. EMBO J. 22: 1359—1369. PMID 12628928 DOI:10.1093/emboj/cdg126
Lin J.C., Tarn W.Y. (2005). Exon selection in alpha-tropomyosin mRNA is regulated by the antagonistic action of RBM4 and PTB. Mol. Cell. Biol. 25: 10111—10121. PMID 16260624 DOI:10.1128/MCB.25.22.10111-10121.2005
Markus M.A., Morris B.J. (2006). Lark is the splicing factor RBM4 and exhibits unique subnuclear localization properties. DNA Cell Biol. 25: 457—464. PMID 16907643 DOI:10.1089/dna.2006.25.457

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9901 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BWF3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9901 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9BWF3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RBM4

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук