RLIM

RLIM
Ідентифікатори
Символи	RLIM, NY-REN-43, RNF12, ring finger protein, LIM domain interacting, MRX61, TOKAS
Зовнішні ІД	OMIM: 300379 MGI: 1342291 HomoloGene: 7920 GeneCards: RLIM
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • transcription repressor complex • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • random inactivation of X chromosome • regulation of dosage compensation by inactivation of X chromosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51132	19820
Ensembl	ENSG00000131263	ENSMUSG00000056537
UniProt	Q9NVW2	Q9WTV7
RefSeq (мРНК)	NM_183353 NM_016120	NM_011276 NM_001358205
RefSeq (білок)	NP_057204 NP_899196	NP_035406 NP_001345134
Локус (UCSC)	Хр. X: 74.58 – 74.61 Mb	Хр. X: 103 – 103.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RLIM (англ. Ring finger protein, LIM domain interacting) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 624 амінокислот, а молекулярна маса — 68 549.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENSDSNDKG		SGDQSAAQRR		SQMDRLDREE		AFYQFVNNLS		EEDYRLMRDN
NLLGTPGEST		EEELLRRLQQ		IKEGPPPQNS		DENRGGDSSD		DVSNGDSIID
WLNSVRQTGN		TTRSGQRGNQ		SWRAVSRTNP		NSGDFRFSLE		INVNRNNGSQ
NSENENEPSA		RRSSGENVEN		NSQRQVENPR		SESTSARPSR		SERNSTEALT
EVPPTRGQRR		ARSRSPDHRR		TRARAERSRS		PLHPMSEIPR		RSHHSISSQT
FEHPLVNETE		GSSRTRHHVT		LRQQISGPEL		LSRGLFAASG		TRNASQGAGS
SDTAASGEST		GSGQRPPTIV		LDLQVRRVRP		GEYRQRDSIA		SRTRSRSQTP
NNTVTYESER		GGFRRTFSRS		ERAGVRTYVS		TIRIPIRRIL		NTGLSETTSV
AIQTMLRQIM		TGFGELSYFM		YSDSDSEPTG		SVSNRNMERA		ESRSGRGGSG
GGSSSGSSSS		SSSSSSSSSS		SSSSSSPSSS		SGGESSETSS		DLFEGSNEGS
SSSGSSGARR		EGRHRAPVTF		DESGSLPFLS		LAQFFLLNED		DDDQPRGLTK
EQIDNLAMRS		FGENDALKTC		SVCITEYTEG		NKLRKLPCSH		EYHVHCIDRW
LSENSTCPIC		RRAVLASGNR		ESVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Her Y.R., Chung I.K. (2009). Ubiquitin ligase RLIM modulates telomere length homeostasis through a proteolysis of TRF1. J. Biol. Chem. 284: 8557—8566. PMID 19164295 DOI:10.1074/jbc.M806702200

Див. також

• Хромосома X