RRAGA

RRAGA
Ідентифікатори
Символи	RRAGA, FIP-1, FIP1, RAGA, Ras related GTP binding A
Зовнішні ІД	OMIM: 612194 MGI: 1915691 HomoloGene: 68522 GeneCards: RRAGA
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein homodimerization activity • GTP binding • phosphoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • ubiquitin protein ligase binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • GATOR1 complex • lysosomal membrane • лізосома • клітинне ядро • Gtr1-Gtr2 GTPase complex Біологічний процес • cellular response to amino acid starvation • смерть клітини • positive regulation of cytolysis • positive regulation of TORC1 signaling • modulation by virus of host process • cellular response to amino acid stimulus • GO:0022415 viral process • negative regulation of autophagy • positive regulation of TOR signaling • GO:0097285 апоптоз • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of macroautophagy • cellular response to starvation • regulation of autophagy Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10670	68441
Ensembl	ENSG00000155876	ENSMUSG00000070934
UniProt	Q7L523	Q80X95
RefSeq (мРНК)	NM_006570	NM_178376
RefSeq (білок)	NP_006561	NP_848463
Локус (UCSC)	Хр. 9: 19.05 – 19.05 Mb	Хр. 4: 86.49 – 86.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRAGA (англ. Ras related GTP binding A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 36 566.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPNTAMKKKV		LLMGKSGSGK		TSMRSIIFAN		YIARDTRRLG		ATIDVEHSHV
RFLGNLVLNL		WDCGGQDTFM		ENYFTSQRDN		IFRNVEVLIY		VFDVESRELE
KDMHYYQSCL		EAILQNSPDA		KIFCLVHKMD		LVQEDQRDLI		FKEREEDLRR
LSRPLECACF		RTSIWDETLY		KAWSSIVYQL		IPNVQQLEMN		LRNFAQIIEA
DEVLLFERAT		FLVISHYQCK		EQRDVHRFEK		ISNIIKQFKL		SCSKLAASFQ
SMEVRNSNFA		AFIDIFTSNT		YVMVVMSDPS		IPSAATLINI		RNARKHFEKL
ERVDGPKHSL		LMR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, лізосомі.

Література

• Schuermann A., Brauers A., Massmann S., Becker W., Joost H.-G. (1995). Cloning of a novel family of mammalian GTP-binding proteins (RagA, RagBs, RagBl) with remote similarity to the Ras-related GTPases. J. Biol. Chem. 270: 28982—28988. PMID 7499430 DOI:10.1074/jbc.270.48.28982
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sekiguchi T., Hirose E., Nakashima N., Ii M., Nishimoto T. (2001). Novel G proteins, Rag C and Rag D, interact with GTP-binding proteins, Rag A and Rag B. J. Biol. Chem. 276: 7246—7257. PMID 11073942 DOI:10.1074/jbc.M004389200
• Peng M., Yin N., Li M.O. (2014). Sestrins function as guanine nucleotide dissociation inhibitors for Rag GTPases to control mTORC1 signaling. Cell. 159: 122—133. PMID 25259925 DOI:10.1016/j.cell.2014.08.038
• Li Y., Kang J., Horwitz M.S. (1997). Interaction of an adenovirus 14.7-kilodalton protein inhibitor of tumor necrosis factor alpha cytolysis with a new member of the GTPase superfamily of signal transducers. J. Virol. 71: 1576—1582. PMID 8995684
• Hirose E., Nakashima N., Sekiguchi T., Nishimoto T. (1998). RagA is a functional homologue of S. cerevisiae Gtr1p involved in the Ran/Gsp1-GTPase pathway. J. Cell Sci. 111: 11—21. PMID 9394008

Див. також

• Хромосома 9