SAP18

SAP18
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HDE
Ідентифікатори
Символи	SAP18, 2HOR0202, SAP18P, Sin3A associated protein 18kDa, Sin3A associated protein 18
Зовнішні ІД	OMIM: 602949 MGI: 3704317 HomoloGene: 4289 GeneCards: SAP18
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone deacetylase activity • RNA binding Клітинна компонента • histone deacetylase complex • nuclear speck • exon-exon junction complex • нуклеоплазма • ASAP complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • transcription, DNA-templated • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • histone deacetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10284	100041953
Ensembl	ENSG00000150459	ENSMUSG00000061104
UniProt	O00422	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005870 NM_001366643	NM_001142441
RefSeq (білок)	NP_005861 NP_001353572	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 21.14 – 21.15 Mb	Хр. 8: 96.55 – 96.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SAP18 (англ. Sin3A associated protein 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 153 амінокислот, а молекулярна маса — 17 561.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVESRVTQE		EIKKEPEKPI		DREKTCPLLL		RVFTTNNGRH		HRMDEFSRGN
VPSSELQIYT		WMDATLKELT		SLVKEVYPEA		RKKGTHFNFA		IVFTDVKRPG
YRVKEIGSTM		SGRKGTDDSM		TLQSQKFQIG		DYLDIAITPP		NRAPPPSGRM
RPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (1997). Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. Cell. 89: 357—364. PMID 9150135 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80216-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 13