SCML2

SCML2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OI1, 2BIV, 2MEM, 2VYT, 4EDU
Ідентифікатори
Символи	SCML2, sex comb on midleg like 2 (Drosophila), Scm polycomb group protein like 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300208 HomoloGene: 38139 GeneCards: SCML2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • PcG protein complex • клітинне ядро Біологічний процес • anatomical structure morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10389	367793
Ensembl	ENSG00000102098	ENSRNOG00000003726
UniProt	Q9UQR0	D3ZRL8
RefSeq (мРНК)	NM_006089	XM_006227323 XM_006256906 XM_008758409 XM_008758410 XM_008773216 XM_008773217 XM_017588215 XM_017588216 XM_017588217 XM_017588218 XM_017588219 XM_017588220 XM_017588221 XM_017602287 XM_017602288 XM_017602289
RefSeq (білок)	NP_006080	XP_038956122 XP_038956123
Локус (UCSC)	Хр. X: 18.24 – 18.35 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCML2 (англ. Scm polycomb group protein like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 700 амінокислот, а молекулярна маса — 77 257.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQTVNEDSM		DVKKENQEKT		PQSSTSSVQR		DDFHWEEYLK		ETGSISAPSE
CFRQSQIPPV		NDFKVGMKLE		ARDPRNATSV		CIATVIGITG		ARLRLRLDGS
DNRNDFWRLV		DSPDIQPVGT		CEKEGDLLQP		PLGYQMNTSS		WPMFLLKTLN
GSEMASATLF		KKEPPKPPLN		NFKVGMKLEA		IDKKNPYLIC		PATIGDVKGD
EVHITFDGWS		GAFDYWCKYD		SRDIFPAGWC		RLTGDVLQPP		GTSVPIVKNI
AKTESSPSEA		SQHSMQSPQK		TTLILPTQQV		RRSSRIKPPG		PTAVPKRSSS
VKNITPRKKG		PNSGKKEKPL		PVICSTSAAS		LKSLTRDRGM		LYKDVASGPC
KIVMSTVCVY		VNKHGNFGPH		LDPKRIQQLP		DHFGPGPVNV		VLRRIVQACV
DCALETKTVF		GYLKPDNRGG		EVITASFDGE		THSIQLPPVN		SASFALRFLE
NFCHSLQCDN		LLSSQPFSSS		RGHTHSSAEH		DKNQSAKEDV		TERQSTKRSP
QQTVPYVVPL		SPKLPKTKEY		ASEGEPLFAG		GSAIPKEENL		SEDSKSSSLN
SGNYLNPACR		NPMYIHTSVS		QDFSRSVPGT		TSSPLVGDIS		PKSSPHEVKF
QMQRKSEAPS		YIAVPDPSVL		KQGFSKDPST		WSVDEVIQFM		KHTDPQISGP
LADLFRQHEI		DGKALFLLKS		DVMMKYMGLK		LGPALKLCYY		IEKLKEGKYS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sathyamurthy A., Allen M.D., Murzin A.G., Bycroft M. (2003). Crystal structure of the malignant brain tumor (MBT) repeats in sex comb on midleg-like 2 (SCML2). J. Biol. Chem. 278: 46968—46973. PMID 12952983 DOI:10.1074/jbc.M306469200

Див. також

• Хромосома X