SEPHS1

SEPHS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FD5, 3FD6
Ідентифікатори
Символи	SEPHS1, SELD, SPS, SPS1, Selenophosphate synthetase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600902 MGI: 1923580 HomoloGene: 56558 GeneCards: SEPHS1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • selenide, water dikinase activity • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • protein homodimerization activity • identical protein binding • protein heterodimerization activity • kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • Ядерна мембрана • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • фосфорилювання • selenocysteine biosynthetic process • selenium compound metabolic process • tRNA seleno-modification Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22929	109079
Ensembl	ENSG00000086475	ENSMUSG00000026662
UniProt	P49903 Q5T5U7	Q8BH69
RefSeq (мРНК)	NM_001195602 NM_001195604 NM_012247 NM_001375769 NM_001375770	NM_175400
RefSeq (білок)	NP_001182531 NP_001182533 NP_036379 NP_001362698	NP_780609 NP_001349636 NP_001349637 NP_001349638 NP_001349639
Локус (UCSC)	Хр. 10: 13.32 – 13.35 Mb	Хр. 2: 4.88 – 4.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEPHS1 (англ. Selenophosphate synthetase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 392 амінокислот, а молекулярна маса — 42 911.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTRESFNPE		SYELDKSFRL		TRFTELKGTG		CKVPQDVLQK		LLESLQENHF
QEDEQFLGAV		MPRLGIGMDT		CVIPLRHGGL		SLVQTTDYIY		PIVDDPYMMG
RIACANVLSD		LYAMGVTECD		NMLMLLGVSN		KMTDRERDKV		MPLIIQGFKD
AAEEAGTSVT		GGQTVLNPWI		VLGGVATTVC		QPNEFIMPDN		AVPGDVLVLT
KPLGTQVAVA		VHQWLDIPEK		WNKIKLVVTQ		EDVELAYQEA		MMNMARLNRT
AAGLMHTFNA		HAATDITGFG		ILGHAQNLAK		QQRNEVSFVI		HNLPVLAKMA
AVSKACGNMF		GLMHGTCPET		SGGLLICLPR		EQAARFCAEI		KSPKYGEGHQ
AWIIGIVEKG		NRTARIIDKP		RIIEVAPQVA		TQNVNPTPGA		TS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Low S.C., Harney J.W., Berry M.J. (1995). Cloning and functional characterization of human selenophosphate synthetase, an essential component of selenoprotein synthesis. J. Biol. Chem. 270: 21659—21664. PMID 7665581 DOI:10.1074/jbc.270.37.21659
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang K.T., Wang J., Li L.F., Su X.D. (2009). Crystal structures of catalytic intermediates of human selenophosphate synthetase 1. J. Mol. Biol. 390: 747—759. PMID 19477186 DOI:10.1016/j.jmb.2009.05.032

Див. також

• Хромосома 10