SF1

SF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1K1G, 1O0P, 1OPI, 2M09, 4FXW, 4FXX
Ідентифікатори
Символи	SF1, BBP, D11S636, MBBP, ZCCHC25, ZFM1, ZNF162, splicing factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601516 MGI: 1095403 HomoloGene: 138518 GeneCards: SF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • identical protein binding • pre-mRNA branch point binding • RNA binding Клітинна компонента • рибосома • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Leydig cell differentiation • mRNA processing • regulation of steroid biosynthetic process • male sex determination • transcription, DNA-templated • spliceosomal complex assembly • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • mRNA splicing, via spliceosome • nuclear body organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7536	22668
Ensembl	ENSG00000168066	ENSMUSG00000024949
UniProt	Q15637	Q64213
RefSeq (мРНК)	NM_001178030 NM_001178031 NM_004630 NM_201995 NM_201997 NM_201998 NM_001346363 NM_001346364 NM_001346409 NM_001346410 NM_001378956 NM_001378957	NM_001110791 NM_011750
RefSeq (білок)	NP_001171501 NP_001171502 NP_001333292 NP_001333293 NP_001333338 NP_001333339 NP_004621 NP_973724 NP_973726 NP_973727 NP_001365885 NP_001365886	NP_001104261 NP_035880 NP_001347322 NP_001390363 NP_001390364 NP_001390365 NP_001390368 NP_001390369 NP_001390370 NP_001390371 NP_001390372 NP_001390373 NP_001390374 NP_001390375 NP_001390376 NP_001390377 NP_001390378
Локус (UCSC)	Хр. 11: 64.76 – 64.78 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SF1 (англ. Splicing factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 68 330.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATGANATPL		DFPSKKRKRS		RWNQDTMEQK		TVIPGMPTVI		PPGLTREQER
AYIVQLQIED		LTRKLRTGDL		GIPPNPEDRS		PSPEPIYNSE		GKRLNTREFR
TRKKLEEERH		NLITEMVALN		PDFKPPADYK		PPATRVSDKV		MIPQDEYPEI
NFVGLLIGPR		GNTLKNIEKE		CNAKIMIRGK		GSVKEGKVGR		KDGQMLPGED
EPLHALVTAN		TMENVKKAVE		QIRNILKQGI		ETPEDQNDLR		KMQLRELARL
NGTLREDDNR		ILRPWQSSET		RSITNTTVCT		KCGGAGHIAS		DCKFQRPGDP
QSAQDKARMD		KEYLSLMAEL		GEAPVPASVG		STSGPATTPL		ASAPRPAAPA
NNPPPPSLMS		TTQSRPPWMN		SGPSESRPYH		GMHGGGPGGP		GGGPHSFPHP
LPSLTGGHGG		HPMQHNPNGP		PPPWMQPPPP		PMNQGPHPPG		HHGPPPMDQY
LGSTPVGSGV		YRLHQGKGMM		PPPPMGMMPP		PPPPPSGQPP		PPPSGPLPPW
QQQQQQPPPP		PPPSSSMASS		TPLPWQQNTT		TTTTSAGTGS		IPPWQQQQAA
AAASPGAPQM		QGNPTMVPLP		PGVQPPLPPG		APPPPPPPPP		GSAGMMYAPP
PPPPPPMDPS		NFVTMMGMGV		AGMPPFGMPP		APPPPPPQN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Toda T., Iida A., Miwa T., Nakamura Y., Imai T. (1994). Isolation and characterization of a novel gene encoding nuclear protein at a locus (D11S636) tightly linked to multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1). Hum. Mol. Genet. 3: 465—470. PMID 7912130 DOI:10.1093/hmg/3.3.465
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kraemer A., Quentin M., Mulhauser F. (1998). Diverse modes of alternative splicing of human splicing factor SF1 deduced from the exon-intron structure of the gene. Gene. 211: 29—37. PMID 9573336 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00058-4
• Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
• Zhang D., Paley A.J., Childs G. (1998). The transcriptional repressor ZFM1 interacts with and modulates the ability of EWS to activate transcription. J. Biol. Chem. 273: 18086—18091. PMID 9660765 DOI:10.1074/jbc.273.29.18086
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 11