SIAH1

SIAH1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A25, 4C9Z, 4CA1, 4I7B, 4I7C, 4I7D, 4X3G
Ідентифікатори
Символи	SIAH1, SIAH1A, siah E3 ubiquitin protein ligase 1, BURHAS
Зовнішні ІД	OMIM: 602212 MGI: 108064 HomoloGene: 20654 GeneCards: SIAH1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • protein C-terminus binding • ubiquitin conjugating enzyme binding Клітинна компонента • beta-catenin destruction complex • цитоплазма • клітинне ядро • early endosome • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • клітинний цикл • Сперматогенез • axon guidance • multicellular organism development • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • GO:0044257 protein catabolic process • positive regulation of apoptotic process • нейробіологія розвитку • Убіквітин-залежний протеоліз • диференціація клітин • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein destabilization • neuron apoptotic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of netrin-activated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6477	20437
Ensembl	ENSG00000196470	ENSMUSG00000036840
UniProt	Q8IUQ4	P61092
RefSeq (мРНК)	NM_001006610 NM_003031 NM_001006611	NM_009172
RefSeq (білок)	NP_001006611 NP_003022	NP_033198
Локус (UCSC)	Хр. 16: 48.36 – 48.45 Mb	Хр. 8: 87.45 – 87.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIAH1 (англ. Siah E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 31 123.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRQTATALP		TGTSKCPPSQ		RVPALTGTTA		SNNDLASLFE		CPVCFDYVLP
PILQCQSGHL		VCSNCRPKLT		CCPTCRGPLG		SIRNLAMEKV		ANSVLFPCKY
ASSGCEITLP		HTEKADHEEL		CEFRPYSCPC		PGASCKWQGS		LDAVMPHLMH
QHKSITTLQG		EDIVFLATDI		NLPGAVDWVM		MQSCFGFHFM		LVLEKQEKYD
GHQQFFAIVQ		LIGTRKQAEN		FAYRLELNGH		RRRLTWEATP		RSIHEGIATA
IMNSDCLVFD		TSIAQLFAEN		GNLGINVTIS		MC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинний цикл, убіквітинування білків, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Medhioub M., Vaury C., Hamelin R., Thomas G. (2000). Lack of somatic mutation in the coding sequence of SIAH1 in tumors hemizygous for this candidate tumor suppressor gene. Int. J. Cancer. 87: 794—797. PMID 10956387 DOI:10.1002/1097-0215(20000915)87:6<794::AID-IJC5>3.0.CO;2-B
• Mei Y., Xie C., Xie W., Wu Z., Wu M. (2007). Siah-1S, a novel splice variant of Siah-1 (seven in absentia homolog), counteracts Siah-1-mediated downregulation of beta-catenin. Oncogene. 26: 6319—6331. PMID 17420721 DOI:10.1038/sj.onc.1210449
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matsuzawa S., Takayama S., Froesch B.A., Zapata J.M., Reed J.C. (1998). p53-inducible human homologue of Drosophila seven in absentia (Siah) inhibits cell growth: suppression by BAG-1. EMBO J. 17: 2736—2747. PMID 9582267 DOI:10.1093/emboj/17.10.2736
• Hu G., Fearon E.R. (1999). Siah-1 N-terminal RING domain is required for proteolysis function, and C-terminal sequences regulate oligomerization and binding to target proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 724—732. PMID 9858595 DOI:10.1128/MCB.19.1.724
• Matsuzawa S., Reed J.C. (2001). Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for beta-catenin degradation linked to p53 responses. Mol. Cell. 7: 915—926. PMID 11389839 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00242-8

Див. також

• Хромосома 16