SMC1A

SMC1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2WD5
Ідентифікатори
Символи	SMC1A, CDLS2, DXS423E, SB1.8, SMC1, SMC1L1, SMC1alpha, SMCB, structural maintenance of chromosomes 1A, EIEE85, DEE85
Зовнішні ІД	OMIM: 300040 MGI: 1344345 HomoloGene: 4597 GeneCards: SMC1A
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • mediator complex binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ATP binding • RNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • GO:0034991 meiotic cohesin complex • хромосома • нуклеоплазма • condensed nuclear chromosome • центромера • клітинне ядро • кінетохор • гіалоплазма • GO:0000798 cohesin complex • nuclear matrix • mitotic spindle pole Біологічний процес • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • cellular response to DNA damage stimulus • stem cell population maintenance • поділ клітини • negative regulation of DNA endoreduplication • mitotic sister chromatid cohesion • mitotic sister chromatid segregation • клітинний цикл • response to radiation • GO:0100026 Репарація ДНК • sister chromatid cohesion • response to DNA damage checkpoint signaling • GO:0007126 мейоз • regulation of mitotic spindle assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8243	24061
Ensembl	ENSG00000072501	ENSMUSG00000041133
UniProt	Q14683 Q68EN4	Q9CU62
RefSeq (мРНК)	NM_006306 NM_001281463	NM_019710
RefSeq (білок)	NP_001268392 NP_006297 NP_006297.2	NP_062684
Локус (UCSC)	Хр. X: 53.37 – 53.42 Mb	Хр. X: 150.8 – 150.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMC1A (англ. Structural maintenance of chromosomes 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 233 амінокислот, а молекулярна маса — 143 233.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGFLKLIEIE		NFKSYKGRQI		IGPFQRFTAI		IGPNGSGKSN		LMDAISFVLG
EKTSNLRVKT		LRDLIHGAPV		GKPAANRAFV		SMVYSEEGAE		DRTFARVIVG
GSSEYKINNK		VVQLHEYSEE		LEKLGILIKA		RNFLVFQGAV		ESIAMKNPKE
RTALFEEISR		SGELAQEYDK		RKKEMVKAEE		DTQFNYHRKK		NIAAERKEAK
QEKEEADRYQ		RLKDEVVRAQ		VQLQLFKLYH		NEVEIEKLNK		ELASKNKEIE
KDKKRMDKVE		DELKEKKKEL		GKMMREQQQI		EKEIKEKDSE		LNQKRPQYIK
AKENTSHKIK		KLEAAKKSLQ		NAQKHYKKRK		GDMDELEKEM		LSVEKARQEF
EERMEEESQS		QGRDLTLEEN		QVKKYHRLKE		EASKRAATLA		QELEKFNRDQ
KADQDRLDLE		ERKKVETEAK		IKQKLREIEE		NQKRIEKLEE		YITTSKQSLE
EQKKLEGELT		EEVEMAKRRI		DEINKELNQV		MEQLGDARID		RQESSRQQRK
AEIMESIKRL		YPGSVYGRLI		DLCQPTQKKY		QIAVTKVLGK		NMDAIIVDSE
KTGRDCIQYI		KEQRGEPETF		LPLDYLEVKP		TDEKLRELKG		AKLVIDVIRY
EPPHIKKALQ		YACGNALVCD		NVEDARRIAF		GGHQRHKTVA		LDGTLFQKSG
VISGGASDLK		AKARRWDEKA		VDKLKEKKER		LTEELKEQMK		AKRKEAELRQ
VQSQAHGLQM		RLKYSQSDLE		QTKTRHLALN		LQEKSKLESE		LANFGPRIND
IKRIIQSRER		EMKDLKEKMN		QVEDEVFEEF		CREIGVRNIR		EFEEEKVKRQ
NEIAKKRLEF		ENQKTRLGIQ		LDFEKNQLKE		DQDKVHMWEQ		TVKKDENEIE
KLKKEEQRHM		KIIDETMAQL		QDLKNQHLAK		KSEVNDKNHE		MEEIRKKLGG
ANKEMTHLQK		EVTAIETKLE		QKRSDRHNLL		QACKMQDIKL		PLSKGTMDDI
SQEEGSSQGE		DSVSGSQRIS		SIYAREALIE		IDYGDLCEDL		KDAQAEEEIK
QEMNTLQQKL		NEQQSVLQRI		AAPNMKAMEK		LESVRDKFQE		TSDEFEAARK
RAKKAKQAFE		QIKKERFDRF		NACFESVATN		IDEIYKALSR		NSSAQAFLGP
ENPEEPYLDG		INYNCVAPGK		RFRPMDNLSG		GEKTVAALAL		LFAIHSYKPA
PFFVLDEIDA		ALDNTNIGKV		ANYIKEQSTC		NFQAIVISLK		EEFYTKAESL
IGVYPEQGDC		VISKVLTFDL		TKYPDANPNP		NEQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen Y., Sharp Z.D., Lee W.-H. (1997). HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins. J. Biol. Chem. 272: 24081—24087. PMID 9295362 DOI:10.1074/jbc.272.38.24081
• Zheng L., Chen Y., Lee W.-H. (1999). Hec1p, an evolutionarily conserved coiled-coil protein, modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5417—5428. PMID 10409732 DOI:10.1128/MCB.19.8.5417
• Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749
• Gregson H.C., Van Hooser A.A., Ball A.R. Jr., Brinkley B.R., Yokomori K. (2002). Localization of human SMC1 protein at kinetochores. Chromosome Res. 10: 267—277. PMID 12199140 DOI:10.1023/A:1016563523208

Див. також

• Хромосома X