SMC5

SMC5
Ідентифікатори
Символи	SMC5, SMC5L1, structural maintenance of chromosomes 5
Зовнішні ІД	OMIM: 609386 MGI: 2385088 HomoloGene: 41009 GeneCards: SMC5
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding Клітинна компонента • site of double-strand break • PML body • Smc5-Smc6 complex • хромосома • теломера • Міжклітинні контакти • interchromatin granule • клітинне ядро • Нуклеоплазма • nuclear speck • Статеві хромосоми Біологічний процес • DNA recombination • positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • telomere maintenance via recombination • клітинне старіння • positive regulation of chromosome segregation • double-strand break repair via homologous recombination • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • sister chromatid cohesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23137	226026
Ensembl	ENSG00000198887	ENSMUSG00000024943
UniProt	Q8IY18	Q8CG46
RefSeq (мРНК)	NM_015110	NM_001252684 NM_001252685 NM_153808
RefSeq (білок)	NP_055925	NP_001239613 NP_001239614 NP_722503
Локус (UCSC)	Хр. 9: 70.26 – 70.35 Mb	Хр. 19: 23.18 – 23.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMC5 (англ. Structural maintenance of chromosomes 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 101 амінокислот, а молекулярна маса — 128 806.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPSKKTST		PSPQPSKRAL		PRDPSSEVPS		KRKNSAPQLP		LLQSSGPFVE
GSIVRISMEN		FLTYDICEVS		PGPHLNMIVG		ANGTGKSSIV		CAICLGLAGK
PAFMGRADKV		GFFVKRGCSR		GMVEIELFRA		SGNLVITREI		DVAKNQSFWF
INKKSTTQKI		VEEKVAALNI		QVGNLCQFLP		QDKVGEFAKL		SKIELLEATE
KSIGPPEMHK		YHCELKNLRE		KEKQLETSCK		EKTEYLQKMV		QRNERYKQDV
ERFYERKRHL		DLIEMLEAKR		PWVEYENVRQ		EYEEVKLVRD		RVKEEVRKLK
EGQIPVTCRI		EEMENERHNL		EARIKEKATD		IKEASQKCKQ		KQDVIERKDK
HIEELQQALI		VKQNEELDRQ		RRIGNTRKMI		EDLQNELKTT		ENCENLQPQI
DAITNDLRRI		QDEKALCEGE		IIDKRRERET		LEKEKKSVDD		HIVRFDNLMN
QKEDKLRQRF		RDTYDAVLWL		RNNRDKFKQR		VCEPIMLTIN		MKDNKNAKYI
ENHIPSNDLR		AFVFESQEDM		EVFLKEVRDN		KKLRVNAVIA		PKSSYADKAP
SRSLNELKQY		GFFSYLRELF		DAPDPVMSYL		CCQYHIHEVP		VGTEKTRERI
ERVIQETRLK		QIYTAEEKYV		VKTSFYSNKV		ISSNTSLKVA		QFLTVTVDLE
QRRHLEEQLK		EIHRKLQAVD		SGLIALRETS		KHLEHKDNEL		RQKKKELLER
KTKKRQLEQK		ISSKLGSLKL		MEQDTCNLEE		EERKASTKIK		EINVQKAKLV
TELTNLIKIC		TSLHIQKVDL		ILQNTTVISE		KNKLESDYMA		ASSQLRLTEQ
HFIELDENRQ		RLLQKCKELM		KRARQVCNLG		AEQTLPQEYQ		TQVPTIPNGH
NSSLPMVFQD		LPNTLDEIDA		LLTEERSRAS		CFTGLNPTIV		QEYTKREEEI
EQLTEELKGK		KVELDQYREN		ISQVKERWLN		PLKELVEKIN		EKFSNFFSSM
QCAGEVDLHT		ENEEDYDKYG		IRIRVKFRSS		TQLHELTPHH		QSGGERSVST
MLYLMALQEL		NRCPFRVVDE		INQGMDPINE		RRVFEMVVNT		ACKENTSQYF
FITPKLLQNL		PYSEKMTVLF		VYNGPHMLEP		NTWNLKAFQR		RRRRITFTQP
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Potts P.R., Yu H. (2005). Human MMS21/NSE2 is a SUMO ligase required for DNA repair. Mol. Cell. Biol. 25: 7021—7032. PMID 16055714 DOI:10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005
• Potts P.R., Porteus M.H., Yu H. (2006). Human SMC5/6 complex promotes sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1/3 cohesin complex to double-strand breaks. EMBO J. 25: 3377—3388. PMID 16810316 DOI:10.1038/sj.emboj.7601218
• Potts P.R., Yu H. (2007). The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 581—590. PMID 17589526 DOI:10.1038/nsmb1259
• Taylor E.M., Copsey A.C., Hudson J.J., Vidot S., Lehmann A.R. (2008). Identification of the proteins, including MAGEG1, that make up the human SMC5-6 protein complex. Mol. Cell. Biol. 28: 1197—1206. PMID 18086888 DOI:10.1128/MCB.00767-07
• Behlke-Steinert S., Touat-Todeschini L., Skoufias D.A., Margolis R.L. (2009). SMC5 and MMS21 are required for chromosome cohesion and mitotic progression. Cell Cycle. 8: 2211—2218. PMID 19502785 DOI:10.4161/cc.8.14.8979

Див. також

• Хромосома 9