SNRK

SNRK
Ідентифікатори
Символи	SNRK, HSNFRK, SNF related kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 612760 MGI: 108104 HomoloGene: 9797 GeneCards: SNRK
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ATP binding • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • protein phosphorylation • myeloid cell differentiation • GO:0007243 intracellular signal transduction • фосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54861	20623
Ensembl	ENSG00000163788	ENSMUSG00000038145
UniProt	Q9NRH2	Q8VDU5
RefSeq (мРНК)	NM_001100594 NM_017719 NM_001330750	NM_001164572 NM_133741 NM_001357774 NM_001357775 NM_001357776
RefSeq (білок)	NP_001094064 NP_001317679 NP_060189	NP_001158044 NP_598502 NP_001344703 NP_001344704 NP_001344705
Локус (UCSC)	Хр. 3: 43.29 – 43.42 Mb	Хр. 9: 121.95 – 122 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRK (англ. SNF related kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 84 276.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGFKRGYDG		KIAGLYDLDK		TLGRGHFAVV		KLARHVFTGE		KVAVKVIDKT
KLDTLATGHL		FQEVRCMKLV		QHPNIVRLYE		VIDTQTKLYL		ILELGDGGDM
FDYIMKHEEG		LNEDLAKKYF		AQIVHAISYC		HKLHVVHRDL		KPENVVFFEK
QGLVKLTDFG		FSNKFQPGKK		LTTSCGSLAY		SAPEILLGDE		YDAPAVDIWS
LGVILFMLVC		GQPPFQEAND		SETLTMIMDC		KYTVPSHVSK		ECKDLITRML
QRDPKRRASL		EEIENHPWLQ		GVDPSPATKY		NIPLVSYKNL		SEEEHNSIIQ
RMVLGDIADR		DAIVEALETN		RYNHITATYF		LLAERILREK		QEKEIQTRSA
SPSNIKAQFR		QSWPTKIDVP		QDLEDDLTAT		PLSHATVPQS		PARAADSVLN
GHRSKGLCDS		AKKDDLPELA		GPALSTVPPA		SLKPTASGRK		CLFRVEEDEE
EDEEDKKPMS		LSTQVVLRRK		PSVTNRLTSR		KSAPVLNQIF		EEGESDDEFD
MDENLPPKLS		RLKMNIASPG		TVHKRYHRRK		SQGRGSSCSS		SETSDDDSES
RRRLDKDSGF		TYSWHRRDSS		EGPPGSEGDG		GGQSKPSNAS		GGVDKASPSE
NNAGGGSPSS		GSGGNPTNTS		GTTRRCAGPS		NSMQLASRSA		GELVESLKLM
SLCLGSQLHG		STKYIIDPQN		GLSFSSVKVQ		EKSTWKMCIS		STGNAGQVPA
VGGIKFFSDH		MADTTTELER		IKSKNLKNNV		LQLPLCEKTI		SVNIQRNPKE
GLLCASSPAS		CCHVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Kertesz N., Samson J., Debacker C., Wu H., Labastie M.-C. (2002). Cloning and characterization of human and mouse SNRK sucrose non-fermenting protein (SNF-1)-related kinases. Gene. 294: 13—24. PMID 12234663 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00829-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Becker W., Heukelbach J., Kentrup H., Joost H.G. (1996). Molecular cloning and characterization of a novel mammalian protein kinase harboring a homology domain that defines a subfamily of serine/threonine kinases. Eur. J. Biochem. 235: 736—743. PMID 8654423 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.00736.x

Див. також

• Хромосома 3