SPHK1

SPHK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VZB, 3VZC, 3VZD, 4L02, 4V24
Ідентифікатори
Символи	SPHK1, SPHK, sphingosine kinase 1, SK1
Зовнішні ІД	OMIM: 603730 MGI: 1316649 HomoloGene: 39748 GeneCards: SPHK1
Онтологія гена Молекулярна функція • sphingosine-1-phosphate receptor activity • transferase activity • nucleotide binding • DNA binding • calmodulin binding • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase 2A binding • ATP binding • magnesium ion binding • sphinganine kinase activity • D-erythro-sphingosine kinase activity • NAD+ kinase activity • lipid binding • acetyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • клітинне ядро • гіалоплазма • clathrin-coated pit • endocytic vesicle • early endosome membrane • presynapse • ендосома • endosome membrane • міжклітинні контакти • синапс Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of fibroblast proliferation • sphingosine metabolic process • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • sphingosine biosynthetic process • positive regulation of mitotic cell cycle • sphingolipid biosynthetic process • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of cell growth • brain development • blood vessel development • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • згортання білків • positive regulation of cell population proliferation • regulation of interleukin-1 beta production • inflammatory response • sphingoid catabolic process • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of smooth muscle contraction • calcium-mediated signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway • lipid phosphorylation • positive regulation of cell migration • negative regulation of apoptotic process • фосфорилювання • обмін речовин • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of mitotic nuclear division • cellular response to hydrogen peroxide • DNA biosynthetic process • sphingolipid mediated signaling pathway • protein acetylation • regulation of endocytosis • positive regulation of interleukin-17 production • response to tumor necrosis factor • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • regulation of phagocytosis • regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of ceramide biosynthetic process • positive regulation of p38MAPK cascade • regulation of microglial cell activation • regulation of endosomal vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8877	20698
Ensembl	ENSG00000176170	ENSMUSG00000061878
UniProt	Q9NYA1	Q8CI15
RefSeq (мРНК)	NM_001142601 NM_001142602 NM_021972 NM_182965 NM_001355139	NM_001172472 NM_001172473 NM_001172475 NM_011451 NM_025367 NM_001372484 NM_001372485 NM_001372486 NM_001372487 NM_001372488 NM_001372489
RefSeq (білок)	NP_001136073 NP_001136074 NP_068807 NP_892010 NP_001342068	NP_001165943 NP_001165944 NP_001165946 NP_079643 NP_001359413 NP_001359414 NP_001359415 NP_001359416 NP_001359417 NP_001359418
Локус (UCSC)	Хр. 17: 76.38 – 76.39 Mb	Хр. 11: 116.42 – 116.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPHK1 (англ. Sphingosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 384 амінокислот, а молекулярна маса — 42 518.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPAGGPRGV		LPRPCRVLVL		LNPRGGKGKA		LQLFRSHVQP		LLAEAEISFT
LMLTERRNHA		RELVRSEELG		RWDALVVMSG		DGLMHEVVNG		LMERPDWETA
IQKPLCSLPA		GSGNALAASL		NHYAGYEQVT		NEDLLTNCTL		LLCRRLLSPM
NLLSLHTASG		LRLFSVLSLA		WGFIADVDLE		SEKYRRLGEM		RFTLGTFLRL
AALRTYRGRL		AYLPVGRVGS		KTPASPVVVQ		QGPVDAHLVP		LEEPVPSHWT
VVPDEDFVLV		LALLHSHLGS		EMFAAPMGRC		AAGVMHLFYV		RAGVSRAMLL
RLFLAMEKGR		HMEYECPYLV		YVPVVAFRLE		PKDGKGVFAV		DGELMVSEAV
QGQVHPNYFW		MVSGCVEPPP		SWKPQQMPPP		EEPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Melendez A.J., Carlos-Dias E., Gosink M., Allen J.M., Takacs L. (2000). Human sphingosine kinase: molecular cloning, functional characterization and tissue distribution. Gene. 251: 19—26. PMID 10863092 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00205-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lacana E., Maceyka M., Milstien S., Spiegel S. (2002). Cloning and characterization of a protein kinase A anchoring protein (AKAP)-related protein that interacts with and regulates sphingosine kinase 1 activity. J. Biol. Chem. 277: 32947—32953. PMID 12080051 DOI:10.1074/jbc.M202841200
• Inagaki Y., Li P.Y., Wada A., Mitsutake S., Igarashi Y. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human sphingosine kinase 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 311: 168—173. PMID 14575709 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.09.194
• Jarman K.E., Moretti P.A., Zebol J.R., Pitson S.M. (2010). Translocation of sphingosine kinase 1 to the plasma membrane is mediated by calcium- and integrin-binding protein 1. J. Biol. Chem. 285: 483—492. PMID 19854831 DOI:10.1074/jbc.M109.068395

Див. також

• Хромосома 17