SRRM4

SRRM4
Ідентифікатори
Символи	SRRM4, KIAA1853, MU-MB-2.76, nSR100, serine/arginine repetitive matrix 4
Зовнішні ІД	OMIM: 613103 MGI: 1916205 HomoloGene: 49869 GeneCards: SRRM4
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of RNA splicing • mRNA processing • диференціація клітин • слух • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • нейробіологія розвитку • neuron maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84530	68955
Ensembl	ENSG00000139767	ENSMUSG00000063919
UniProt	A7MD48	Q8BKA3
RefSeq (мРНК)	NM_194286	NM_026886
RefSeq (білок)	NP_919262	NP_081162 NP_001390326
Локус (UCSC)	Хр. 12: 118.98 – 119.16 Mb	Хр. 5: 116.58 – 116.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRRM4 (англ. Serine/arginine repetitive matrix 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 68 559.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVQQGEKQ		LFEKFWRGTF		KAVATPRPES		IIVASITARK		PLPRTEPQNN
PVVPAQDGPS		EKLGQHLATE		PLGTNSWERD		KTCRELGATR		GHSASHDKDL
TPPPSSRGKK		KKKKSTRKKR		RRSSSYSPSP		VKKKKKKSSK		KHKRRRSFSK
KRRHSSSSPK		SKRRDEKRHK		KQSRSRPRKS		HRHRHHRCPS		RSQSSESRPS
SCESRHRGRS		PEEGQKSRRR		HSRRCSKTLC		KDSPEAQSSR		PPSQPLQMLG
YLSARGVITG		SGSAADLFTK		TASPLTTSRG		RSQEYDSGND		TSSPPSTQTS
SARSRGQEKG		SPSGGLSKSR		ELNSGNTSDS		GNSFTTSSPQ		NKGAMLENLS
PTSRGRESRG		FQSPCLECAE		VKKSSLVPST		ARSSPMKGCS		RSSSYASTRS
SSHSSRSPNP		RASPRYTQSR		STSSEKRSYS		RSPSYSSKSG		KRSPPSRSSR
SRRSPSYSRY		SPSRERDPKY		SEKDSQQRER		ERARRRRRSY		SPMRKRRRDS
PSHLEARRIT		SARKRPIPYY		RPSPSSSGSL		SSTSSWYSSS		SSRSASRSYS
RSRSRSRSRR		RSRTRTSSSS		SSRSPSPGSR		SRSRSRSRSR		SRSRSQSRSY
SSADSYSSTR		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12