TAP2

TAP2
Ідентифікатори
Символи	TAP2, ABC18, ABCB3, APT2, D6S217E, PSF-2, PSF2, RING11, transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), transporter 2, ATP binding cassette subfamily B member
Зовнішні ІД	OMIM: 170261 MGI: 98484 HomoloGene: 37323 GeneCards: TAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC protein binding • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • nucleotide binding • ABC-type peptide transporter activity • transporter activity • tapasin binding • MHC class Ib protein binding • ABC-type peptide antigen transporter activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TAP1 binding • ATP binding • peptide transmembrane transporter activity • MHC class I protein binding • TAP2 binding Клітинна компонента • TAP complex • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум • nuclear speck • phagocytic vesicle membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • MHC class I peptide loading complex Біологічний процес • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib via ER pathway, TAP-dependent • трансмембранний транспорт • protein transport • peptide transport • GO:0022415 viral process • cytosol to endoplasmic reticulum transport • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • peptide antigen transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6891	21355
Ensembl	ENSG00000204267 ENSG00000206299 ENSG00000228582 ENSG00000206235 ENSG00000225967 ENSG00000237599 ENSG00000223481 ENSG00000232326	ENSMUSG00000024339
UniProt	Q03519	P36371
RefSeq (мРНК)	NM_018833 NM_000544 NM_001290043	NM_011530
RefSeq (білок)	NP_000535 NP_001276972 NP_061313	NP_035660
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.82 – 32.84 Mb	Хр. 17: 34.42 – 34.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAP2 (англ. Transporter 2, ATP binding cassette subfamily B member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 75 664.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLPDLRPWT		SLLLVDAALL		WLLQGPLGTL		LPQGLPGLWL		EGTLRLGGLW
GLLKLRGLLG		FVGTLLLPLC		LATPLTVSLR		ALVAGASRAP		PARVASAPWS
WLLVGYGAAG		LSWSLWAVLS		PPGAQEKEQD		QVNNKVLMWR		LLKLSRPDLP
LLVAAFFFLV		LAVLGETLIP		HYSGRVIDIL		GGDFDPHAFA		SAIFFMCLFS
FGSSLSAGCR		GGCFTYTMSR		INLRIREQLF		SSLLRQDLGF		FQETKTGELN
SRLSSDTTLM		SNWLPLNANV		LLRSLVKVVG		LYGFMLSISP		RLTLLSLLHM
PFTIAAEKVY		NTRHQEVLRE		IQDAVARAGQ		VVREAVGGLQ		TVRSFGAEEH
EVCRYKEALE		QCRQLYWRRD		LERALYLLVR		RVLHLGVQML		MLSCGLQQMQ
DGELTQGSLL		SFMIYQESVG		SYVQTLVYIY		GDMLSNVGAA		EKVFSYMDRQ
PNLPSPGTLA		PTTLQGVVKF		QDVSFAYPNR		PDRPVLKGLT		FTLRPGEVTA
LVGPNGSGKS		TVAALLQNLY		QPTGGQVLLD		EKPISQYEHC		YLHSQVVSVG
QEPVLFSGSV		RNNIAYGLQS		CEDDKVMAAA		QAAHADDFIQ		EMEHGIYTDV
GEKGSQLAAG		QKQRLAIARA		LVRDPRVLIL		DEATSALDVQ		CEQALQDWNS
RGDRTVLVIA		HRLQTVQRAH		QILVLQEGKL		QKLAQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Bahram S., Arnold D., Bresnahan M., Strominger J.L., Spies T. (1991). Two putative subunits of a peptide pump encoded in the human major histocompatibility complex class II region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10094—10098. PMID 1946428 DOI:10.1073/pnas.88.22.10094
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cano P., Baxter-Lowe L.A. (1995). Novel human TAP2*103 allele shows further polymorphism in the ATP-binding domain. Tissue Antigens. 45: 139—142. PMID 7792761 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02431.x
• Tang J., Allen S., Karita E., Musonda R., Kaslow R.A. (1998). New TAP2 polymorphisms in Africans. Tissue Antigens. 51: 556—562. PMID 9672156 DOI:10.1111/j.1399-0039.1998.tb02992.x
• Hewitt E.W., Gupta S.S., Lehner P.J. (2001). The human cytomegalovirus gene product US6 inhibits ATP binding by TAP. EMBO J. 20: 387—396. PMID 11157746 DOI:10.1093/emboj/20.3.387
• Colonna M., Bresnahan M., Bahram S., Strominger J.L., Spies T. (1992). Allelic variants of the human putative peptide transporter involved in antigen processing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 3932—3936. PMID 1570316 DOI:10.1073/pnas.89.9.3932

Див. також

• Хромосома 6