TCF12

TCF12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KNH, 4JOL
Ідентифікатори
Символи	TCF12, CRS3, HEB, HTF4, HsT17266, bHLHb20, TCF-12, transcription factor 12, p64, HH26
Зовнішні ІД	OMIM: 600480 MGI: 101877 HomoloGene: 40774 GeneCards: TCF12
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • SMAD binding • cAMP response element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • nuclear speck • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle organ development • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of neuron differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6938	21406
Ensembl	ENSG00000140262	ENSMUSG00000032228
UniProt	Q99081	Q61286
RefSeq (мРНК)	NM_001306219 NM_001306220 NM_003205 NM_207036 NM_207037 NM_207038 NM_207040 NM_001322151 NM_001322152 NM_001322154 NM_001322156 NM_001322157 NM_001322158 NM_001322159 NM_001322161 NM_001322162 NM_001322164 NM_001322165	NM_001253862 NM_001253863 NM_001253864 NM_001253865 NM_011544
RefSeq (білок)	NP_001293148 NP_001293149 NP_001309080 NP_001309081 NP_001309083 NP_001309085 NP_001309086 NP_001309087 NP_001309088 NP_001309090 NP_001309091 NP_001309093 NP_001309094 NP_003196 NP_996919 NP_996920 NP_996921 NP_996923	NP_001240791 NP_001240792 NP_001240793 NP_001240794 NP_035674
Локус (UCSC)	Хр. 15: 56.92 – 57.3 Mb	Хр. 9: 71.75 – 72.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCF12 (англ. Transcription factor 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 682 амінокислот, а молекулярна маса — 72 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPQQQRMAA		IGTDKELSDL		LDFSAMFSPP		VNSGKTRPTT		LGSSQFSGSG
IDERGGTTSW		GTSGQPSPSY		DSSRGFTDSP		HYSDHLNDSR		LGAHEGLSPT
PFMNSNLMGK		TSERGSFSLY		SRDTGLPGCQ		SSLLRQDLGL		GSPAQLSSSG
KPGTAYYSFS		ATSSRRRPLH		DSAALDPLQA		KKVRKVPPGL		PSSVYAPSPN
SDDFNRESPS		YPSPKPPTSM		FASTFFMQDG		THNSSDLWSS		SNGMSQPGFG
GILGTSTSHM		SQSSSYGNLH		SHDRLSYPPH		SVSPTDINTS		LPPMSSFHRG
STSSSPYVAA		SHTPPINGSD		SILGTRGNAA		GSSQTGDALG		KALASIYSPD
HTSSSFPSNP		STPVGSPSPL		TGTSQWPRPG		GQAPSSPSYE		NSLHSLQSRM
EDRLDRLDDA		IHVLRNHAVG		PSTSLPAGHS		DIHSLLGPSH		NAPIGSLNSN
YGGSSLVASS		RSASMVGTHR		EDSVSLNGNH		SVLSSTVTTS		STDLNHKTQE
NYRGGLQSQS		GTVVTTEIKT		ENKEKDENLH		EPPSSDDMKS		DDESSQKDIK
VSSRGRTSST		NEDEDLNPEQ		KIEREKERRM		ANNARERLRV		RDINEAFKEL
GRMCQLHLKS		EKPQTKLLIL		HQAVAVILSL		EQQVRERNLN		PKAACLKRRE
EEKVSAVSAE		PPTTLPGTHP		GLSETTNPMG		HM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhang Y., Bina M. (1992). The nucleotide sequence of the human transcription factor HTF4a cDNA. DNA Seq. 2: 397—403. PMID 1446075 DOI:10.3109/10425179209020819
• Hu J.S., Olson E.N., Kingston R.E. (1992). HEB, a helix-loop-helix protein related to E2A and ITF2 that can modulate the DNA-binding ability of myogenic regulatory factors. Mol. Cell. Biol. 12: 1031—1042. PMID 1312219 DOI:10.1128/MCB.12.3.1031
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 15