THOC1

THOC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WXP
Ідентифікатори
Символи	THOC1, HPR1, P84, P84N5, THO complex 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606930 MGI: 1919668 HomoloGene: 38012 GeneCards: THOC1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • transcription export complex • nuclear matrix • intercellular bridge • THO complex • THO complex part of transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • regulation of DNA recombination • mRNA transport • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA damage checkpoint • mRNA processing • regulation of DNA-templated transcription, elongation • viral mRNA export from host cell nucleus • transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • negative regulation of isotype switching to IgA isotypes • Сплайсинг РНК • replication fork processing • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9984	225160
Ensembl	ENSG00000079134	ENSMUSG00000024287
UniProt	Q96FV9	Q8R3N6
RefSeq (мРНК)	NM_005131	NM_153552
RefSeq (білок)	NP_005122	NP_705780
Локус (UCSC)	Хр. 18: 0.21 – 0.27 Mb	Хр. 18: 9.96 – 10 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THOC1 (англ. THO complex 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 75 666.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPTPPLFSL		PEARTRFTKS		TREALNNKNI		KPLLSTFSQV		PGSENEKKCT
LDQAFRGILE		EEIINHSSCE		NVLAIISLAI		GGVTEGICTA		STPFVLLGDV
LDCLPLDQCD		TIFTFVEKNV		ATWKSNTFYS		AGKNYLLRMC		NDLLRRLSKS
QNTVFCGRIQ		LFLARLFPLS		EKSGLNLQSQ		FNLENVTVFN		TNEQESTLGQ
KHTEDREEGM		DVEEGEMGDE		EAPTTCSIPI		DYNLYRKFWS		LQDYFRNPVQ
CYEKISWKTF		LKYSEEVLAV		FKSYKLDDTQ		ASRKKMEELK		TGGEHVYFAK
FLTSEKLMDL		QLSDSNFRRH		ILLQYLILFQ		YLKGQVKFKS		SNYVLTDEQS
LWIEDTTKSV		YQLLSENPPD		GERFSKMVEH		ILNTEENWNS		WKNEGCPSFV
KERTSDTKPT		RIIRKRTAPE		DFLGKGPTKK		ILMGNEELTR		LWNLCPDNME
ACKSETREHM		PTLEEFFEEA		IEQADPENMV		ENEYKAVNNS		NYGWRALRLL
ARRSPHFFQP		TNQQFKSLPE		YLENMVIKLA		KELPPPSEEI		KTGEDEDEED
NDALLKENES		PDVRRDKPVT		GEQIEVFANK		LGEQWKILAP		YLEMKDSEIR
QIECDSEDMK		MRAKQLLVAW		QDQEGVHATP		ENLINALNKS		GLSDLAESLT
NDNETNS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 DOI:10.1083/jcb.127.3.609
• Gasparri F., Sola F., Locatelli G., Muzio M. (2004). The death domain protein p84N5, but not the short isoform p84N5s, is cell cycle-regulated and shuttles between the nucleus and the cytoplasm. FEBS Lett. 574: 13—19. PMID 15358532 DOI:10.1016/j.febslet.2004.07.074
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Doostzadeh-Cizeron J., Evans R., Yin S., Goodrich D.W. (1999). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is inhibited by association with Rb protein. Mol. Biol. Cell. 10: 3251—3261. PMID 10512864 DOI:10.1091/mbc.10.10.3251
• Doostzadeh-Cizeron J., Yin S., Goodrich D.W. (2000). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is associated with caspase-6 and NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 275: 25336—25341. PMID 10840029 DOI:10.1074/jbc.M000793200
• Doostzadeh-Cizeron J., Terry N.H., Goodrich D.W. (2001). The nuclear death domain protein p84N5 activates a G2/M cell cycle checkpoint prior to the onset of apoptosis. J. Biol. Chem. 276: 1127—1132. PMID 11050087 DOI:10.1074/jbc.M006944200

Див. також

• Хромосома 18