THOC2

THOC2
Ідентифікатори
Символи	THOC2, CXorf3, THO2, dJ506G2.1, hTREX120, MRX12, MRX35, THO complex 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300395 MGI: 2442413 HomoloGene: 69669 GeneCards: THOC2
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome, non-syndromic X-linked intellectual disability
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • THO complex • nuclear speck • THO complex part of transcription export complex • transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • poly(A)+ mRNA export from nucleus • mRNA processing • mRNA transport • neuron development • viral mRNA export from host cell nucleus • Сплайсинг РНК • generation of neurons • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0000767 cell morphogenesis • blastocyst development • регуляція експресії генів • regulation of mRNA export from nucleus • negative regulation of neuron projection development • stem cell division Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57187	331401
Ensembl	ENSG00000125676	ENSMUSG00000037475
UniProt	Q8NI27	B1AZI6
RefSeq (мРНК)	NM_001081550 NM_020449	NM_001033422
RefSeq (білок)	NP_001075019	NP_001028594
Локус (UCSC)	Хр. X: 123.6 – 123.73 Mb	Хр. X: 40.88 – 41.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THOC2 (англ. THO complex 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 593 амінокислот, а молекулярна маса — 182 775.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAVVVPA		EWIKNWEKSG		RGEFLHLCRI		LSENKSHDSS		TYRDFQQALY
ELSYHVIKGN		LKHEQASNVL		SDISEFREDM		PSILADVFCI		LDIETNCLEE
KSKRDYFTQL		VLACLYLVSD		TVLKERLDPE		TLESLGLIKQ		SQQFNQKSVK
IKTKLFYKQQ		KFNLLREENE		GYAKLIAELG		QDLSGSITSD		LILENIKSLI
GCFNLDPNRV		LDVILEVFEC		RPEHDDFFIS		LLESYMSMCE		PQTLCHILGF
KFKFYQEPNG		ETPSSLYRVA		AVLLQFNLID		LDDLYVHLLP		ADNCIMDEHK
REIAEAKQIV		RKLTMVVLSS		EKMDEREKEK		EKEEEKVEKP		PDNQKLGLLE
ALLKIGDWQH		AQNIMDQMPP		YYAASHKLIA		LAICKLIHIT		IEPLYRRVGV
PKGAKGSPVN		ALQNKRAPKQ		AESFEDLRRD		VFNMFCYLGP		HLSHDPILFA
KVVRIGKSFM		KEFQSDGSKQ		EDKEKTEVIL		SCLLSITDQV		LLPSLSLMDC
NACMSEELWG		MFKTFPYQHR		YRLYGQWKNE		TYNSHPLLVK		VKAQTIDRAK
YIMKRLTKEN		VKPSGRQIGK		LSHSNPTILF		DYILSQIQKY		DNLITPVVDS
LKYLTSLNYD		VLAYCIIEAL		ANPEKERMKH		DDTTISSWLQ		SLASFCGAVF
RKYPIDLAGL		LQYVANQLKA		GKSFDLLILK		EVVQKMAGIE		ITEEMTMEQL
EAMTGGEQLK		AEGGYFGQIR		NTKKSSQRLK		DALLDHDLAL		PLCLLMAQQR
NGVIFQEGGE		KHLKLVGKLY		DQCHDTLVQF		GGFLASNLST		EDYIKRVPSI
DVLCNEFHTP		HDAAFFLSRP		MYAHHISSKY		DELKKSEKGS		KQQHKVHKYI
TSCEMVMAPV		HEAVVSLHVS		KVWDDISPQF		YATFWSLTMY		DLAVPHTSYE
REVNKLKVQM		KAIDDNQEMP		PNKKKKEKER		CTALQDKLLE		EEKKQMEHVQ
RVLQRLKLEK		DNWLLAKSTK		NETITKFLQL		CIFPRCIFSA		IDAVYCARFV
ELVHQQKTPN		FSTLLCYDRV		FSDIIYTVAS		CTENEASRYG		RFLCCMLETV
TRWHSDRATY		EKECGNYPGF		LTILRATGFD		GGNKADQLDY		ENFRHVVHKW
HYKLTKASVH		CLETGEYTHI		RNILIVLTKI		LPWYPKVLNL		GQALERRVHK
ICQEEKEKRP		DLYALAMGYS		GQLKSRKSYM		IPENEFHHKD		PPPRNAVASV
QNGPGGGPSS		SSIGSASKSD		ESSTEETDKS		RERSQCGVKA		VNKASSTTPK
GNSSNGNSGS		NSNKAVKEND		KEKGKEKEKE		KKEKTPATTP		EARVLGKDGK
EKPKEERPNK		DEKARETKER		TPKSDKEKEK		FKKEEKAKDE		KFKTTVPNAE
SKSTQERERE		KEPSRERDIA		KEMKSKENVK		GGEKTPVSGS		LKSPVPRSDI
PEPEREQKRR		KIDTHPSPSH		SSTVKDSLIE		LKESSAKLYI		NHTPPPLSKS
KEREMDKKDL		DKSRERSRER		EKKDEKDRKE		RKRDHSNNDR		EVPPDLTKRR
KEENGTMGVS		KHKSESPCES		PYPNEKDKEK		NKSKSSGKEK		GSDSFKSEKM
DKISSGGKKE		SRHDKEKIEK		KEKRDSSGGK		EEKKHHKSSD		KHR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Li Y., Wang X., Zhang X., Goodrich D.W. (2005). Human hHpr1/p84/Thoc1 regulates transcriptional elongation and physically links RNA polymerase II and RNA processing factors. Mol. Cell. Biol. 25: 4023—4033. PMID 15870275 DOI:10.1128/MCB.25.10.4023-4033.2005
• Boyne J.R., Colgan K.J., Whitehouse A. (2008). Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication. PLoS Pathog. 4: E1000194—E1000194. PMID 18974867 DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
• Folco E.G., Lee C.S., Dufu K., Yamazaki T., Reed R. (2012). The proteins PDIP3 and ZC11A associate with the human TREX complex in an ATP-dependent manner and function in mRNA export. PLoS ONE. 7: E43804—E43804. PMID 22928037 DOI:10.1371/journal.pone.0043804

Див. також

• Хромосома X