TREX2

TREX2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Y97
Ідентифікатори
Символи	TREX2, three prime repair exonuclease 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300370 MGI: 1346343 HomoloGene: 8046 GeneCards: TREX2
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • exodeoxyribonuclease III activity • exonuclease activity • hydrolase activity • protein homodimerization activity • magnesium ion binding • 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • 3'-5' exonuclease activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • DNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11219	24102
Ensembl	ENSG00000183479	ENSMUSG00000031372
UniProt	Q9BQ50	Q9R1A9
RefSeq (мРНК)	NM_080701 NM_080699 NM_080700	NM_011907
RefSeq (білок)	NP_542432	NP_036037
Локус (UCSC)	Хр. X: 153.44 – 153.47 Mb	Хр. X: 72.48 – 72.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TREX2 (англ. Three prime repair exonuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 279 амінокислот, а молекулярна маса — 30 621.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRAGSPLPR		SSWPRMDDCG		SRSRCSPTLC		SSLRTCYPRG		NITMSEAPRA
ETFVFLDLEA		TGLPSVEPEI		AELSLFAVHR		SSLENPEHDE		SGALVLPRVL
DKLTLCMCPE		RPFTAKASEI		TGLSSEGLAR		CRKAGFDGAV		VRTLQAFLSR
QAGPICLVAH		NGFDYDFPLL		CAELRRLGAR		LPRDTVCLDT		LPALRGLDRA
HSHGTRARGR		QGYSLGSLFH		RYFRAEPSAA		HSAEGDVHTL		LLIFLHRAAE
LLAWADEQAR		GWAHIEPMYL		PPDDPSLEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Mazur D.J., Perrino F.W. (1999). Identification and expression of the TREX1 and TREX2 cDNA sequences encoding mammalian 3'-->5' exonucleases. J. Biol. Chem. 274: 19655—19660. PMID 10391904 DOI:10.1074/jbc.274.28.19655
• Mazur D.J., Perrino F.W. (2001). Structure and expression of the TREX1 and TREX2 3'-->5' exonuclease genes. J. Biol. Chem. 276: 14718—14727. PMID 11278605 DOI:10.1074/jbc.M010051200
• Mazur D.J., Perrino F.W. (2001). Excision of 3' termini by the Trex1 and TREX2 3'-->5' exonucleases. Characterization of the recombinant proteins. J. Biol. Chem. 276: 17022—17029. PMID 11279105 DOI:10.1074/jbc.M100623200
• Perrino F.W., Harvey S., McMillin S., Hollis T. (2005). The human TREX2 3' ->5'-exonuclease structure suggests a mechanism for efficient nonprocessive DNA catalysis. J. Biol. Chem. 280: 15212—15218. PMID 15661738 DOI:10.1074/jbc.M500108200

Див. також

• Хромосома X