TRIM22

TRIM22
Ідентифікатори
Символи	TRIM22, GPSTAF50, RNF94, STAF50, tripartite motif containing 22
Зовнішні ІД	OMIM: 606559 HomoloGene: 48399 GeneCards: TRIM22
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Тільце Кахаля • nuclear speck • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • комплекс Ґольджі Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of autophagy • interferon-gamma-mediated signaling pathway • protein trimerization • response to virus • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • regulation of protein localization • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0022415 viral process • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10346	н/д
Ensembl	ENSG00000132274	н/д
UniProt	Q8IYM9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_006074 NM_001199573	н/д
RefSeq (білок)	NP_001186502 NP_006065	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 5.69 – 5.74 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

TRIM22 (англ. Tripartite motif containing 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 947.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFSVKVDIE		KEVTCPICLE		LLTEPLSLDC		GHSFCQACIT		AKIKESVIIS
RGESSCPVCQ		TRFQPGNLRP		NRHLANIVER		VKEVKMSPQE		GQKRDVCEHH
GKKLQIFCKE		DGKVICWVCE		LSQEHQGHQT		FRINEVVKEC		QEKLQVALQR
LIKEDQEAEK		LEDDIRQERT		AWKNYIQIER		QKILKGFNEM		RVILDNEEQR
ELQKLEEGEV		NVLDNLAAAT		DQLVQQRQDA		STLISDLQRR		LRGSSVEMLQ
DVIDVMKRSE		SWTLKKPKSV		SKKLKSVFRV		PDLSGMLQVL		KELTDVQYYW
VDVMLNPGSA		TSNVAISVDQ		RQVKTVRTCT		FKNSNPCDFS		AFGVFGCQYF
SSGKYYWEVD		VSGKIAWILG		VHSKISSLNK		RKSSGFAFDP		SVNYSKVYSR
YRPQYGYWVI		GLQNTCEYNA		FEDSSSSDPK		VLTLFMAVPP		CRIGVFLDYE
AGIVSFFNVT		NHGALIYKFS		GCRFSRPAYP		YFNPWNCLVP		MTVCPPSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Tissot C., Mechti N. (1995). Molecular cloning of a new interferon-induced factor that represses human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat expression. J. Biol. Chem. 270: 14891—14898. PMID 7797467 DOI:10.1074/jbc.270.25.14891
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Duan Z., Gao B., Xu W., Xiong S. (2008). Identification of TRIM22 as a RING finger E3 ubiquitin ligase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 502—506. PMID 18656448 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.070
• Barr S.D., Smiley J.R., Bushman F.D. (2008). The interferon response inhibits HIV particle production by induction of TRIM22. PLoS Pathog. 4: E1000007—E1000007. PMID 18389079 DOI:10.1371/journal.ppat.1000007
• Sivaramakrishnan G., Sun Y., Tan S.K., Lin V.C. (2009). Dynamic localization of tripartite motif-containing 22 in nuclear and nucleolar bodies. Exp. Cell Res. 315: 1521—1532. PMID 19331816 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.01.028
• Sivaramakrishnan G., Sun Y., Rajmohan R., Lin V.C. (2009). B30.2/SPRY domain in tripartite motif-containing 22 is essential for the formation of distinct nuclear bodies. FEBS Lett. 583: 2093—2099. PMID 19481078 DOI:10.1016/j.febslet.2009.05.036

Див. також

• Хромосома 11