TUT1

TUT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E5G
Ідентифікатори
Символи	TUT1, PAPD2, RBM21, STARPAP, TUTase, URLC6, terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific, TENT1
Зовнішні ІД	OMIM: 610641 MGI: 1917294 HomoloGene: 69361 GeneCards: TUT1
шифр КФ	2.7.7.52
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • nucleotidyltransferase activity • polynucleotide adenylyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • RNA uridylyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • enzyme binding • ATP binding • mRNA 3'-UTR binding Клітинна компонента • nuclear speck • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • snRNA processing • mRNA processing • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • histone mRNA catabolic process • mRNA polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64852	70044
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000071645
UniProt	Q9H6E5	Q8R3F9
RefSeq (мРНК)	NM_022830 NM_001367906	NM_197993
RefSeq (білок)	NP_073741 NP_001354835	NP_932110
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 19: 8.93 – 8.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TUT1 (англ. Terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 874 амінокислот, а молекулярна маса — 93 847.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVDSDVES		LPRGGFRCCL		CHVTTANRPS		LDAHLGGRKH		RHLVELRAAR
KAQGLRSVFV		SGFPRDVDSA		QLSEYFLAFG		PVASVVMDKD		KGVFAIVEMG
DVGAREAVLS		QSQHSLGGHR		LRVRPREQKE		FQSPASKSPK		GAAPDSHQLA
KALAEAADVG		AQMIKLVGLR		ELSEAERQLR		SLVVALMQEV		FTEFFPGCVV
HPFGSSINSF		DVHGCDLDLF		LDLGDLEEPQ		PVPKAPESPS		LDSALASPLD
PQALACTPAS		PPDSQPPASP		QDSEALDFET		PSSSLAPQTP		DSALASETLA
SPQSLPPASP		LLEDREEGDL		GKASELAETP		KEEKAEGAAM		LELVGSILRG
CVPGVYRVQT		VPSARRPVVK		FCHRPSGLHG		DVSLSNRLAL		HNSRFLSLCS
ELDGRVRPLV		YTLRCWAQGR		GLSGSGPLLS		NYALTLLVIY		FLQTRDPPVL
PTVSQLTQKA		GEGEQVEVDG		WDCSFPRDAS		RLEPSINVEP		LSSLLAQFFS
CVSCWDLRGS		LLSLREGQAL		PVAGGLPSNL		WEGLRLGPLN		LQDPFDLSHN
VAANVTSRVA		GRLQNCCRAA		ANYCRSLQYQ		RRSSRGRDWG		LLPLLQPSSP
SSLLSATPIP		LPLAPFTQLT		AALVQVFREA		LGCHIEQATK		RTRSEGGGTG
ESSQGGTSKR		LKVDGQKNCC		EEGKEEQQGC		AGDGGEDRVE		EMVIEVGEMV
QDWAMQSPGQ		PGDLPLTTGK		HGAPGEEGQP		SHAALAERGP		KGHEAAQEWS
QGEAGKGASL		PSSASWRCAL		WHRVWQGRRR		ARRRLQQQTK		EGAGGGAGTR
AGWLATEAQV		TQELKGLSGG		EERPETEPLL		SFVASVSPAD		RMLTVTPLQD
PQGLFPDLHH		FLQVFLPQAI		RHLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
• Gonzales M.L., Mellman D.L., Anderson R.A. (2008). CKIalpha is associated with and phosphorylates star-PAP and is also required for expression of select star-PAP target messenger RNAs. J. Biol. Chem. 283: 12665—12673. PMID 18305108 DOI:10.1074/jbc.M800656200
• Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Див. також

• Хромосома 11