VRK1

VRK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KTY, 2KUL, 2LAV, 2RSV, 3OP5
Ідентифікатори
Символи	VRK1, PCH1, PCH1A, vaccinia related kinase 1, VRK serine/threonine kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602168 MGI: 1261847 HomoloGene: 2541 GeneCards: VRK1
Пов'язані генетичні захворювання
	pontocerebellar hypoplasia type 1A, pontocerebellar hypoplasia type 1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone kinase activity (H3-T3 specific); • histone kinase activity (H3-S10 specific); • ATP binding; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• веретено поділу; • нуклеоплазма; • ядерце; • Golgi stack; • цитоскелет; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• фосфорилювання; • поділ клітини; • protein phosphorylation; • mitotic nuclear membrane disassembly; • клітинний цикл; • mitotic nuclear membrane reassembly; • Golgi disassembly; • regulation of cell shape; • protein autophosphorylation; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • peptidyl-threonine phosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7443
	22367
	ENSG00000100749
	ENSMUSG00000021115
	Q99986
	Q80X41
	NM_003384
NM_001029843; NM_001029844; NM_011705; NM_001364365; NM_001364367;
	NM_001364368
	NP_003375
NP_001025014; NP_001025015; NP_035835; NP_001351294; NP_001351296;
	NP_001351297
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VRK1 (англ. Vaccinia related kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 45 476^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRVKAAQAG	RQSSAKRHLA	EQFAVGEIIT	DMAKKEWKVG	LPIGQGGFGC
IYLADMNSSE	SVGSDAPCVV	KVEPSDNGPL	FTELKFYQRA	AKPEQIQKWI
RTRKLKYLGV	PKYWGSGLHD	KNGKSYRFMI	MDRFGSDLQK	IYEANAKRFS
RKTVLQLSLR	ILDILEYIHE	HEYVHGDIKA	SNLLLNYKNP	DQVYLVDYGL
AYRYCPEGVH	KEYKEDPKRC	HDGTIEFTSI	DAHNGVAPSR	RGDLEILGYC
MIQWLTGHLP	WEDNLKDPKY	VRDSKIRYRE	NIASLMDKCF	PEKNKPGEIA
KYMETVKLLD	YTEKPLYENL	RDILLQGLKA	IGSKDDGKLD	LSVVENGGLK
AKTITKKRKK	EIEESKEPGV	EDTEWSNTQT	EEAIQTRSRT	RKRVQK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Nezu J., Oku A., Jones M.H., Shimane M. (1997). Identification of two novel human putative serine/threonine kinases, VRK1 and VRK2, with structural similarity to Vaccinia virus B1R kinase. Genomics. 45: 327—331. PMID 9344656 DOI:10.1006/geno.1997.4938
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lopez-Borges S., Lazo P.A. (2000). The human vaccinia-related kinase 1 (VRK1) phosphorylates threonine-18 within the mdm-2 binding site of the p53 tumour suppressor protein. Oncogene. 19: 3656—3664. PMID 10951572 DOI:10.1038/sj.onc.1203709
Barcia R., Lopez-Borges S., Vega F.M., Lazo P.A. (2002). Kinetic properties of p53 phosphorylation by the human vaccinia-related kinase 1. Arch. Biochem. Biophys. 399: 1—5. PMID 11883897 DOI:10.1006/abbi.2001.2746
Nichols R.J., Traktman P. (2004). Characterization of three paralogous members of the Mammalian vaccinia related kinase family. J. Biol. Chem. 279: 7934—7946. PMID 14645249 DOI:10.1074/jbc.M310813200
Sevilla A., Santos C.R., Vega F.M., Lazo P.A. (2004). Human vaccinia-related kinase 1 (VRK1) activates the ATF2 transcriptional activity by novel phosphorylation on Thr-73 and Ser-62 and cooperates with JNK. J. Biol. Chem. 279: 27458—27465. PMID 15105425 DOI:10.1074/jbc.M401009200