ZRSR2

ZRSR2
Ідентифікатори
Символи	ZRSR2, U2AF1-RS2, U2AF1L2, U2AF1RS2, URP, ZC3H22, zinc finger CCCH-type, RNA binding motif and serine/arginine rich 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300028 MGI: 103287 HomoloGene: 21061 GeneCards: ZRSR2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • pre-mRNA 3'-splice site binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • spliceosomal complex • U12-type spliceosomal complex • нуклеоплазма • U2AF complex Біологічний процес • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8233	22184
Ensembl	ENSG00000169249	ENSMUSG00000031370
UniProt	Q15696	Q62377
RefSeq (мРНК)	NM_005089	NM_009453 NM_178794
RefSeq (білок)	NP_005080	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 15.79 – 15.83 Mb	Хр. X: 162.72 – 162.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZRSR2 (англ. Zinc finger CCCH-type, RNA binding motif and serine/arginine rich 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 58 045.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPEKMTFP		EKPSHKKYRA		ALKKEKRKKR		RQELARLRDS		GLSQKEEEED
TFIEEQQLEE		EKLLERERQR		LHEEWLLREQ		KAQEEFRIKK		EKEEAAKKRQ
EEQERKLKEQ		WEEQQRKERE		EEEQKRQEKK		EKEEALQKML		DQAENELENG
TTWQNPEPPV		DFRVMEKDRA		NCPFYSKTGA		CRFGDRCSRK		HNFPTSSPTL
LIKSMFTTFG		MEQCRRDDYD		PDASLEYSEE		ETYQQFLDFY		EDVLPEFKNV
GKVIQFKVSC		NLEPHLRGNV		YVQYQSEEEC		QAALSLFNGR		WYAGRQLQCE
FCPVTRWKMA		ICGLFEIQQC		PRGKHCNFLH		VFRNPNNEFW		EANRDIYLSP
DRTGSSFGKN		SERRERMGHH		DDYYSRLRGR		RNPSPDHSYK		RNGESERKSS
RHRGKKSHKR		TSKSRERHNS		RSRGRNRDRS		RDRSRGRGSR		SRSRSRSRRS
RRSRSQSSSR		SRSRGRRRSG		NRDRTVQSPK		SK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tronchere H., Wang J., Fu X.D. (1997). A protein related to splicing factor U2AF35 that interacts with U2AF65 and SR proteins in splicing of pre-mRNA. Nature. 388: 397—400. PMID 9237760 DOI:10.1038/41137
• Shen H., Zheng X., Luecke S., Green M.R. (2010). The U2AF35-related protein Urp contacts the 3' splice site to promote U12-type intron splicing and the second step of U2-type intron splicing. Genes Dev. 24: 2389—2394. PMID 21041408 DOI:10.1101/gad.1974810

Див. також

• Хромосома X