Структурна біологія

Приклади структури білків з Protein Data Bank

Структура гемоглобіна — транспортного білка, що знаходиться в еритроцитах і виконує функцію перенесення кисню

Структурна біологія — розділ молекулярної біології, біохімії і біофізики, що займається вивченням структури біологічних макромолекул, зокрема білків і нуклеїнових кислот.

Структурна біоінформатика — це розділ, який вивчає структури біологічних молекул і з'єднань, таких як структури білків, структури РНК, навіть структури ДНК, причому не однієї молекули, а того, як вона укладена в ядрі. Існує два основні підходи — молекулярна динаміка, в якій моделюється рух молекул під дією фізичних полів, яка отримала поштовх до розвитку при розвитку суперкомп'ютерів.

Другий підхід — статистичний, який містить безліч методів, що дозволяють на основі порівнювання послідовностей амінокислот або нуклеотидів з представленими в базах даних, передбачати структуру досліджуваної молекули. Крім передбачення структури однієї молекули в рамках даної секції розглядаються завдання вивчення механізмів розпізнавання білками малих молекул, пророкування обчислювальними методами взаємодії транскрипційних факторів — білків, керуючих експресією генів — з ДНК і ін.

Методи

Для вивчення структури макромолекул застосовуються такі методи:

• Мас-спектрометрія
• Макромолекулярна кристалографія
• Протеолізис
• ЯМР-спектроскопія протеїнів (NMR)
• Електронний парамагнітний резонанс
• Кріо-електронна мікроскропія (cryo-EM)
• Multiangle light scattering
• Small angle scattering
• Ultrafast laser spectroscopy
• Dual-polarization interferometry and circular dichroism

Див. також

• Рентгеноструктурний аналіз
• ЯМР-спектроскопія
• Кріоелектронна мікроскопія
• Надшвидка лазерна спектроскопія

Наукові журнали

Одним з провідних наукових журналів в області структурної біології є Nature Structural & Molecular Biology.

Джерела

Література

• J. Janin & M. Delepierre (1997) Biologie structurale: Principes et méthodes biophysiques, Hermann, Paris, ISBN 978-2705662325
• C. Branden & J. Tooze (1998) Introduction to Protein Structure, Garland Science, ISBN 978-0815323051

Ресурси Інтернету

• Nature: Structural & Molecular Biology magazine website [Архівовано 18 квітня 2012 у WebCite]
• Journal of Structural Biology [Архівовано 3 травня 2020 у Wayback Machine.]
• Structural Biology — The Virtual Library of Biochemistry, Molecular Biology and Cell Biology [Архівовано 18 лютого 2020 у Wayback Machine.]
• Structural Biology in Europe [Архівовано 22 вересня 2020 у Wayback Machine.]