NLRP1

NLRP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PN5, 3KAT, 4IFP, 4IM6
Ідентифікатори
Символи	NLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L/S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR family, pyrin domain containing 1, NLR family pyrin domain containing 1, MSPC, AIADK, JRRP
Зовнішні ІД	OMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 GeneCards: NLRP1
Пов'язані генетичні захворювання
corneal intraepithelial dyskeratosis-palmoplantar hyperkeratosis-laryngeal dyskeratosis syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • nucleotide binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • ATP binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • inflammasome complex • клітинне ядро • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • гіалоплазма • NLRP1 inflammasome complex Біологічний процес • neuron apoptotic process • regulation of apoptotic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • response to muramyl dipeptide • GO:0097285 апоптоз • defense response to bacterium • regulation of inflammatory response • процес імунної системи • inflammatory response • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • NLRP1 inflammasome complex assembly • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22861	637515
Ensembl	ENSG00000091592	ENSMUSG00000070390
UniProt	Q9C000	Q2LKV5 Q2LKV2 Q2LKW6 Q0GKD5
RefSeq (мРНК)	NM_033007 NM_001033053 NM_014922 NM_033004 NM_033006	NM_001039680 NM_001040696 NM_001162414
RefSeq (білок)	NP_001028225 NP_055737 NP_127497 NP_127499 NP_127500	NP_001035786 NP_001155886
Локус (UCSC)	Хр. 17: 5.5 – 5.62 Mb	Хр. 11: 71.04 – 71.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRP1 (англ. NLR family pyrin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 473 амінокислот, а молекулярна маса — 165 866.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGGAWGRLA		CYLEFLKKEE		LKEFQLLLAN		KAHSRSSSGE		TPAQPEKTSG
MEVASYLVAQ		YGEQRAWDLA		LHTWEQMGLR		SLCAQAQEGA		GHSPSFPYSP
SEPHLGSPSQ		PTSTAVLMPW		IHELPAGCTQ		GSERRVLRQL		PDTSGRRWRE
ISASLLYQAL		PSSPDHESPS		QESPNAPTST		AVLGSWGSPP		QPSLAPREQE
APGTQWPLDE		TSGIYYTEIR		EREREKSEKG		RPPWAAVVGT		PPQAHTSLQP
HHHPWEPSVR		ESLCSTWPWK		NEDFNQKFTQ		LLLLQRPHPR		SQDPLVKRSW
PDYVEENRGH		LIEIRDLFGP		GLDTQEPRIV		ILQGAAGIGK		STLARQVKEA
WGRGQLYGDR		FQHVFYFSCR		ELAQSKVVSL		AELIGKDGTA		TPAPIRQILS
RPERLLFILD		GVDEPGWVLQ		EPSSELCLHW		SQPQPADALL		GSLLGKTILP
EASFLITART		TALQNLIPSL		EQARWVEVLG		FSESSRKEYF		YRYFTDERQA
IRAFRLVKSN		KELWALCLVP		WVSWLACTCL		MQQMKRKEKL		TLTSKTTTTL
CLHYLAQALQ		AQPLGPQLRD		LCSLAAEGIW		QKKTLFSPDD		LRKHGLDGAI
ISTFLKMGIL		QEHPIPLSYS		FIHLCFQEFF		AAMSYVLEDE		KGRGKHSNCI
IDLEKTLEAY		GIHGLFGAST		TRFLLGLLSD		EGEREMENIF		HCRLSQGRNL
MQWVPSLQLL		LQPHSLESLH		CLYETRNKTF		LTQVMAHFEE		MGMCVETDME
LLVCTFCIKF		SRHVKKLQLI		EGRQHRSTWS		PTMVVLFRWV		PVTDAYWQIL
FSVLKVTRNL		KELDLSGNSL		SHSAVKSLCK		TLRRPRCLLE		TLRLAGCGLT
AEDCKDLAFG		LRANQTLTEL		DLSFNVLTDA		GAKHLCQRLR		QPSCKLQRLQ
LVSCGLTSDC		CQDLASVLSA		SPSLKELDLQ		QNNLDDVGVR		LLCEGLRHPA
CKLIRLGLDQ		TTLSDEMRQE		LRALEQEKPQ		LLIFSRRKPS		VMTPTEGLDT
GEMSNSTSSL		KRQRLGSERA		ASHVAQANLK		LLDVSKIFPI		AEIAEESSPE
VVPVELLCVP		SPASQGDLHT		KPLGTDDDFW		GPTGPVATEV		VDKEKNLYRV
HFPVAGSYRW		PNTGLCFVMR		EAVTVEIEFC		VWDQFLGEIN		PQHSWMVAGP
LLDIKAEPGA		VEAVHLPHFV		ALQGGHVDTS		LFQMAHFKEE		GMLLEKPARV
ELHHIVLENP		SFSPLGVLLK		MIHNALRFIP		VTSVVLLYHR		VHPEEVTFHL
YLIPSDCSIR		KAIDDLEMKF		QFVRIHKPPP		LTPLYMGCRY		TVSGSGSGML
EILPKELELC		YRSPGEDQLF		SEFYVGHLGS		GIRLQVKDKK		DETLVWEALV
KPGDLMPATT		LIPPARIAVP		SPLDAPQLLH		FVDQYREQLI		ARVTSVEVVL
DKLHGQVLSQ		EQYERVLAEN		TRPSQMRKLF		SLSQSWDRKC		KDGLYQALKE
THPHLIMELW		EKGSKKGLLP		LSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Bertin J., DiStefano P.S. (2000). The PYRIN domain: a novel motif found in apoptosis and inflammation proteins. Cell Death Differ. 7: 1273—1274. PMID 11270363 DOI:10.1038/sj.cdd.4400774
• Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. (2001). The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation. Curr. Biol. 11: R118—R120. PMID 11250163 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00056-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martinon F., Burns K., Tschopp J. (2002). The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. Mol. Cell. 10: 417—426. PMID 12191486 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00599-3
• Liao K.C., Mogridge J. (2009). Expression of Nlrp1b inflammasome components in human fibroblasts confers susceptibility to anthrax lethal toxin. Infect. Immun. 77: 4455—4462. PMID 19651869 DOI:10.1128/IAI.00276-09
• Postigo A., Cross J.R., Downward J., Way M. (2006). Interaction of F1L with the BH3 domain of Bak is responsible for inhibiting vaccinia-induced apoptosis. Cell Death Differ. 13: 1651—1662. PMID 16439990 DOI:10.1038/sj.cdd.4401853

Див. також

• Хромосома 17