CDK12

CDK12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CXA, 4NST, 4UN0, 5ACB
Ідентифікатори
Символи	CDK12, CRK7, CRKR, CRKRS, cyclin-dependent kinase 12, cyclin dependent kinase 12
Зовнішні ІД	OMIM: 615514 MGI: 1098802 HomoloGene: 128632 GeneCards: CDK12
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • ATP binding • cyclin binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription factor binding • protein kinase binding Клітинна компонента • nuclear speck • nuclear cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • cyclin K-CDK12 complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • fibrillar center • хромосома • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex Біологічний процес • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • фосфорилювання • mRNA processing • regulation of cell cycle • protein phosphorylation • regulation of RNA splicing • Сплайсинг РНК • protein autophosphorylation • regulation of MAP kinase activity • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of stem cell differentiation • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51755	69131
Ensembl	ENSG00000167258	ENSMUSG00000003119
UniProt	Q9NYV4	Q14AX6
RefSeq (мРНК)	NM_015083 NM_016507	NM_001109626 NM_001109628 NM_026952
RefSeq (білок)	NP_055898 NP_057591	NP_001103096 NP_001103098 NP_081228
Локус (UCSC)	Хр. 17: 39.46 – 39.56 Mb	Хр. 11: 98.09 – 98.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDK12 (англ. Cyclin dependent kinase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 490 амінокислот, а молекулярна маса — 164 155.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPNSERHGGK		KDGSGGASGT		LQPSSGGGSS		NSRERHRLVS		KHKRHKSKHS
KDMGLVTPEA		ASLGTVIKPL		VEYDDISSDS		DTFSDDMAFK		LDRRENDERR
GSDRSDRLHK		HRHHQHRRSR		DLLKAKQTEK		EKSQEVSSKS		GSMKDRISGS
SKRSNEETDD		YGKAQVAKSS		SKESRSSKLH		KEKTRKEREL		KSGHKDRSKS
HRKRETPKSY		KTVDSPKRRS		RSPHRKWSDS		SKQDDSPSGA		SYGQDYDLSP
SRSHTSSNYD		SYKKSPGSTS		RRQSVSPPYK		EPSAYQSSTR		SPSPYSRRQR
SVSPYSRRRS		SSYERSGSYS		GRSPSPYGRR		RSSSPFLSKR		SLSRSPLPSR
KSMKSRSRSP		AYSRHSSSHS		KKKRSSSRSR		HSSISPVRLP		LNSSLGAELS
RKKKERAAAA		AAAKMDGKES		KGSPVFLPRK		ENSSVEAKDS		GLESKKLPRS
VKLEKSAPDT		ELVNVTHLNT		EVKNSSDTGK		VKLDENSEKH		LVKDLKAQGT
RDSKPIALKE		EIVTPKETET		SEKETPPPLP		TIASPPPPLP		TTTPPPQTPP
LPPLPPIPAL		PQQPPLPPSQ		PAFSQVPASS		TSTLPPSTHS		KTSAVSSQAN
SQPPVQVSVK		TQVSVTAAIP		HLKTSTLPPL		PLPPLLPGDD		DMDSPKETLP
SKPVKKEKEQ		RTRHLLTDLP		LPPELPGGDL		SPPDSPEPKA		ITPPQQPYKK
RPKICCPRYG		ERRQTESDWG		KRCVDKFDII		GIIGEGTYGQ		VYKAKDKDTG
ELVALKKVRL		DNEKEGFPIT		AIREIKILRQ		LIHRSVVNMK		EIVTDKQDAL
DFKKDKGAFY		LVFEYMDHDL		MGLLESGLVH		FSEDHIKSFM		KQLMEGLEYC
HKKNFLHRDI		KCSNILLNNS		GQIKLADFGL		ARLYNSEESR		PYTNKVITLW
YRPPELLLGE		ERYTPAIDVW		SCGCILGELF		TKKPIFQANL		ELAQLELISR
LCGSPCPAVW		PDVIKLPYFN		TMKPKKQYRR		RLREEFSFIP		SAALDLLDHM
LTLDPSKRCT		AEQTLQSDFL		KDVELSKMAP		PDLPHWQDCH		ELWSKKRRRQ
RQSGVVVEEP		PPSKTSRKET		TSGTSTEPVK		NSSPAPPQPA		PGKVESGAGD
AIGLADITQQ		LNQSELAVLL		NLLQSQTDLS		IPQMAQLLNI		HSNPEMQQQL
EALNQSISAL		TEATSQQQDS		ETMAPEESLK		EAPSAPVILP		SAEQTTLEAS
STPADMQNIL		AVLLSQLMKT		QEPAGSLEEN		NSDKNSGPQG		PRRTPTMPQE
EAAACPPHIL		PPEKRPPEPP		GPPPPPPPPP		LVEGDLSSAP		QELNPAVTAA
LLQLLSQPEA		EPPGHLPHEH		QALRPMEYST		RPRPNRTYGN		TDGPETGFSA
IDTDERNSGP		ALTESLVQTL		VKNRTFSGSL		SHLGESSSYQ		GTGSVQFPGD
QDLRFARVPL		ALHPVVGQPF		LKAEGSSNSV		VHAETKLQNY		GELGPGTTGA
SSSGAGLHWG		GPTQSSAYGK		LYRGPTRVPP		RGGRGRGVPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Iorns E., Martens-de Kemp S.R., Lord C.J., Ashworth A. (2009). CRK7 modifies the MAPK pathway and influences the response to endocrine therapy. Carcinogenesis. 30: 1696—1701. PMID 19651820 DOI:10.1093/carcin/bgp187
• Ko T.K., Kelly E., Pines J. (2001). CrkRS: a novel conserved Cdc2-related protein kinase that colocalises with SC35 speckles. J. Cell Sci. 114: 2591—2603. PMID 11683387

Див. також

• Хромосома 17