CLP1

CLP1
Ідентифікатори
Символи	CLP1, HEAB, PCH10, hClp1, cleavage and polyadenylation factor I subunit 1, cleavage factor polyribonucleotide kinase subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608757 MGI: 2138968 HomoloGene: 4975 GeneCards: CLP1
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 10
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • polydeoxyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity • kinase activity • ATP binding • polydeoxyribonucleotide kinase activity • polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity • polynucleotide kinase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • mRNA cleavage factor complex • клітинне ядро • tRNA-intron endonuclease complex • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • фосфорилювання • mRNA processing • mRNA polyadenylation • cerebellar cortex development • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing • tRNA processing • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10978	98985
Ensembl	ENSG00000172409	ENSMUSG00000027079
UniProt	Q92989	Q99LI9
RefSeq (мРНК)	NM_006831 NM_001142597	NM_133840
RefSeq (білок)	NP_001136069 NP_006822	NP_598601
Локус (UCSC)	Хр. 11: 57.65 – 57.66 Mb	Хр. 2: 84.55 – 84.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLP1 (англ. Cleavage and polyadenylation factor I subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 646.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEEANDDKK		PTTKFELERE		TELRFEVEAS		QSVQLELLTG		MAEIFGTELT
RNKKFTFDAG		AKVAVFTWHG		CSVQLSGRTE		VAYVSKDTPM		LLYLNTHTAL
EQMRRQAEKE		EERGPRVMVV		GPTDVGKSTV		CRLLLNYAVR		LGRRPTYVEL
DVGQGSVSIP		GTMGALYIER		PADVEEGFSI		QAPLVYHFGS		TTPGTNIKLY
NKITSRLADV		FNQRCEVNRR		ASVSGCVINT		CGWVKGSGYQ		ALVHAASAFE
VDVVVVLDQE		RLYNELKRDL		PHFVRTVLLP		KSGGVVERSK		DFRRECRDER
IREYFYGFRG		CFYPHAFNVK		FSDVKIYKVG		APTIPDSCLP		LGMSQEDNQL
KLVPVTPGRD		MVHHLLSVST		AEGTEENLSE		TSVAGFIVVT		SVDLEHQVFT
VLSPAPRPLP		KNFLLIMDIR		FMDLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation. Cell. 117: 311—321. PMID 15109492 DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
• Weitzer S., Martinez J. (2007). The human RNA kinase hClp1 is active on 3' transfer RNA exons and short interfering RNAs. Nature. 447: 222—226. PMID 17495927 DOI:10.1038/nature05777
• Ramirez A., Shuman S., Schwer B. (2008). Human RNA 5'-kinase (hClp1) can function as a tRNA splicing enzyme in vivo. RNA. 14: 1737—1745. PMID 18648070 DOI:10.1261/rna.1142908

Див. також

• Хромосома 11