DCAF1

DCAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WA0, 4CC9, 4P7I, 4PXW, 4Z8L, 5AJA
Ідентифікатори
Символи	DCAF1, VPRBP, Vpr (HIV-1) binding protein, DDB1 and CUL4 associated factor 1, RIP
Зовнішні ІД	OMIM: 617259 MGI: 2445220 HomoloGene: 8805 GeneCards: DCAF1
шифр КФ	2.7.11.1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • kinase activity • histone kinase activity (H2A-T120 specific) • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • estrogen receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • COP9 signalosome • клітинне ядро • fibrillar center • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • фосфорилювання • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cell competition in a multicellular organism • Убіквітин-залежний протеоліз • V(D)J-рекомбінація • B cell differentiation • GO:0022415 viral process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9730	321006
Ensembl	ENSG00000145041	ENSMUSG00000040325
UniProt	Q9Y4B6	Q80TR8
RefSeq (мРНК)	NM_001171904 NM_014703 NM_001349168 NM_001349169 NM_001349170 NM_001349171 NM_001387578 NM_001387579 NM_001387580 NM_001387581 NM_001387582 NM_001387583	NM_001015507 NM_001373930 NM_001373931
RefSeq (білок)	NP_001165375 NP_055518 NP_001336097 NP_001336098 NP_001336099 NP_001336100	NP_001015507 NP_001360859 NP_001360860
Локус (UCSC)	Хр. 3: 51.4 – 51.5 Mb	Хр. 9: 106.7 – 106.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCAF1 (англ. DDB1 and CUL4 associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 507 амінокислот, а молекулярна маса — 169 007.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTVVVHVDS		KAELTTLLEQ		WEKEHGSGQD		MVPILTRMSQ		LIEKETEEYR
KGDPDPFDDR		HPGRADPECM		LGHLLRILFK		NDDFMNALVN		AYVMTSREPP
LNTAACRLLL		DIMPGLETAV		VFQEKEGIVE		NLFKWAREAD		QPLRTYSTGL
LGGAMENQDI		AANYRDENSQ		LVAIVLRRLR		ELQLQEVALR		QENKRPSPRK
LSSEPLLPLD		EEAVDMDYGD		MAVDVVDGDQ		EEASGDMEIS		FHLDSGHKTS
SRVNSTTKPE		DGGLKKNKSA		KQGDRENFRK		AKQKLGFSSS		DPDRMFVELS
NSSWSEMSPW		VIGTNYTLYP		MTPAIEQRLI		LQYLTPLGEY		QELLPIFMQL
GSRELMMFYI		DLKQTNDVLL		TFEALKHLAS		LLLHNKFATE		FVAHGGVQKL
LEIPRPSMAA		TGVSMCLYYL		SYNQDAMERV		CMHPHNVLSD		VVNYTLWLME
CSHASGCCHA		TMFFSICFSF		RAVLELFDRY		DGLRRLVNLI		STLEILNLED
QGALLSDDEI		FASRQTGKHT		CMALRKYFEA		HLAIKLEQVK		QSLQRTEGGI
LVHPQPPYKA		CSYTHEQIVE		MMEFLIEYGP		AQLYWEPAEV		FLKLSCVQLL
LQLISIACNW		KTYYARNDTV		RFALDVLAIL		TVVPKIQLQL		AESVDVLDEA
GSTVSTVGIS		IILGVAEGEF		FIHDAEIQKS		ALQIIINCVC		GPDNRISSIG
KFISGTPRRK		LPQNPKSSEH		TLAKMWNVVQ		SNNGIKVLLS		LLSIKMPITD
ADQIRALACK		ALVGLSRSST		VRQIISKLPL		FSSCQIQQLM		KEPVLQDKRS
DHVKFCKYAA		ELIERVSGKP		LLIGTDVSLA		RLQKADVVAQ		SRISFPEKEL
LLLIRNHLIS		KGLGETATVL		TKEADLPMTA		ASHSSAFTPV		TAAASPVSLP
RTPRIANGIA		TRLGSHAAVG		ASAPSAPTAH		PQPRPPQGPL		ALPGPSYAGN
SPLIGRISFI		RERPSPCNGR		KIRVLRQKSD		HGAYSQSPAI		KKQLDRHLPS
PPTLDSIITE		YLREQHARCK		NPVATCPPFS		LFTPHQCPEP		KQRRQAPINF
TSRLNRRASF		PKYGGVDGGC		FDRHLIFSRF		RPISVFREAN		EDESGFTCCA
FSARERFLML		GTCTGQLKLY		NVFSGQEEAS		YNCHNSAITH		LEPSRDGSLL
LTSATWSQPL		SALWGMKSVF		DMKHSFTEDH		YVEFSKHSQD		RVIGTKGDIA
HIYDIQTGNK		LLTLFNPDLA		NNYKRNCATF		NPTDDLVLND		GVLWDVRSAQ
AIHKFDKFNM		NISGVFHPNG		LEVIINTEIW		DLRTFHLLHT		VPALDQCRVV
FNHTGTVMYG		AMLQADDEDD		LMEERMKSPF		GSSFRTFNAT		DYKPIATIDV
KRNIFDLCTD		TKDCYLAVIE		NQGSMDALNM		DTVCRLYEVG		RQRLAEDEDE
EEDQEEEEQE		EEDDDEDDDD		TDDLDELDTD		QLLEAELEED		DNNENAGEDG
DNDFSPSDEE		LANLLEEGED		GEDEDSDADE		EVELILGDTD		SSDNSDLEDD
IILSLNE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang S., Feng Y., Narayan O., Zhao L.-J. (2001). Cytoplasmic retention of HIV-1 regulatory protein Vpr by protein-protein interaction with a novel human cytoplasmic protein VprBP. Gene. 263: 131—140. PMID 11223251 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00583-7
• Jin J., Arias E.E., Chen J., Harper J.W., Walter J.C. (2006). A family of diverse Cul4-Ddb1-interacting proteins includes Cdt2, which is required for S phase destruction of the replication factor Cdt1. Mol. Cell. 23: 709—721. PMID 16949367 DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.010
• Wen X., Duus K.M., Friedrich T.D., de Noronha C.M. (2007). The HIV1 protein Vpr acts to promote G2 cell cycle arrest by engaging a DDB1 and Cullin4A-containing ubiquitin ligase complex using VprBP/DCAF1 as an adaptor. J. Biol. Chem. 282: 27046—27057. PMID 17620334 DOI:10.1074/jbc.M703955200
• Tan L., Ehrlich E., Yu X.F. (2007). DDB1 and Cul4A are required for human immunodeficiency virus type 1 Vpr-induced G2 arrest. J. Virol. 81: 10822—10830. PMID 17626091 DOI:10.1128/JVI.01380-07
• Huang J., Chen J. (2008). VprBP targets Merlin to the Roc1-Cul4A-DDB1 E3 ligase complex for degradation. Oncogene. 27: 4056—4064. PMID 18332868 DOI:10.1038/onc.2008.44

Див. також

• Хромосома 3