DDX25

DDX25
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RB4
Ідентифікатори
Символи	DDX25, GRTH, DEAD-box helicase 25
Зовнішні ІД	OMIM: 607663 MGI: 1353582 HomoloGene: 8310 GeneCards: DDX25
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • chromatoid body • клітинне ядро • catalytic step 2 spliceosome • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • mRNA transport • regulation of translation • RNA secondary structure unwinding • Сперматогенез • spermatid development • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • регуляція експресії генів Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29118	30959
Ensembl	ENSG00000109832	ENSMUSG00000032101
UniProt	Q9UHL0	Q9QY15
RefSeq (мРНК)	NM_013264 NM_001330438	NM_013932
RefSeq (білок)	NP_001317367 NP_037396	NP_038960
Локус (UCSC)	Хр. 11: 125.9 – 125.94 Mb	Хр. 9: 35.45 – 35.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX25 (англ. DEAD-box helicase 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 54 692.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASLLWGGDA		GAAESERLNS		HFSNLSQPRK		NLWGIKSTAV		RNIDGSINNI
NEDDEEDVVD		LAANSLLNKL		IHQSLVESSH		RVEVLQKDPS		SPLYSVKTFE
ELRLKEELLK		GIYAMGFNRP		SKIQEMALPM		MLAHPPQNLI		AQSQSGTGKT
AAFVLAMLSR		VNALELFPQC		LCLAPTYELA		LQTGRVVEQM		GKFCVDVQVM
YAIRGNRIPR		GTDITKQIII		GTPGTVLDWC		FKLKLIDLTK		IRVFVLDEAD
VMIDTQGFSD		HSIRIQRALP		SECQMLLFSA		TFEDSVWHFA		ERIIPDPNVI
KLRKEELTLN		NIRQYYVLCE		HRKDKYQALC		NIYGSITIGQ		AIIFCQTRRN
AKWLTVEMIQ		DGHQVSLLSG		ELTVEQRASI		IQRFRDGKEK		VLITTNVCAR
GIDVKQVTIV		VNFDLPVKQG		EEPDYETYLH		RIGRTGRFGK		KGLAFNMIEV
DELPSLMKIQ		DHFNSSIKQL		NAEDMDEIEK		IDY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, сперматогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Tang P.-Z., Tsai-Morris C.-H., Dufau M.L. (1999). A novel gonadotropin-regulated testicular RNA helicase: a new member of the DEAD-box family. J. Biol. Chem. 274: 37932—37940. PMID 10608860 DOI:10.1074/jbc.274.53.37932
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11