IKBKG

IKBKG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JVX, 2JVY, 3BRT, 3BRV, 3CL3, 3FX0, 4BWN, 5AAY
Ідентифікатори
Символи	IKBKG, AMCBX1, FIP-3, FIP3, Fip3p, IKK-gamma, IMD33, IP, IP1, IP2, IPD2, NEMO, ZC2HC9, IKKAP1, IKKG, inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma, EDAID1, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 300248 MGI: 1338074 HomoloGene: 2698 GeneCards: IKBKG
Пов'язані генетичні захворювання
anhidrotic ectodermal dysplasia-immunodeficiency-osteopetrosis-lymphedema syndrome, X-linked mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to IKBKG deficiency, Hypohidrotic ectodermal dysplasia with immune deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • linear polyubiquitin binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • peroxisome proliferator activated receptor binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • spindle pole • ubiquitin ligase complex • внутрішньоклітинний • IkappaB kinase complex • mitotic spindle • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • response to virus • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • JNK cascade • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • stress-activated MAPK cascade • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • inflammatory response • GO:0022415 viral process • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • T cell receptor signaling pathway • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • establishment of vesicle localization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of neuron death • GO:0097285 апоптоз • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of macroautophagy • protein deubiquitination • anoikis • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • interleukin-1-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8517	16151
Ensembl	ENSG00000269335	ENSMUSG00000004221
UniProt	Q9Y6K9	O88522
RefSeq (мРНК)	NM_001099856 NM_001099857 NM_001145255 NM_003639 NM_001321396 NM_001321397 NM_001377312 NM_001377313 NM_001377314 NM_001377315	NM_001136067 NM_001161421 NM_001161422 NM_001161423 NM_001161424 NM_010547 NM_178590
RefSeq (білок)	NP_001093326 NP_001093327 NP_001138727 NP_001308325 NP_001308326 NP_003630 NP_001364241 NP_001364242 NP_001364243 NP_001364244	NP_001129539 NP_001154893 NP_001154894 NP_001154895 NP_001154896 NP_034677 NP_848705
Локус (UCSC)	Хр. X: 154.54 – 154.57 Mb	Хр. X: 73.44 – 73.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IKBKG (англ. Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 48 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNRHLWKSQL		CEMVQPSGGP		AADQDVLGEE		SPLGKPAMLH		LPSEQGAPET
LQRCLEENQE		LRDAIRQSNQ		ILRERCEELL		HFQASQREEK		EFLMCKFQEA
RKLVERLGLE		KLDLKRQKEQ		ALREVEHLKR		CQQQMAEDKA		SVKAQVTSLL
GELQESQSRL		EAATKECQAL		EGRARAASEQ		ARQLESEREA		LQQQHSVQVD
QLRMQGQSVE		AALRMERQAA		SEEKRKLAQL		QVAYHQLFQE		YDNHIKSSVV
GSERKRGMQL		EDLKQQLQQA		EEALVAKQEV		IDKLKEEAEQ		HKIVMETVPV
LKAQADIYKA		DFQAERQARE		KLAEKKELLQ		EQLEQLQREY		SKLKASCQES
ARIEDMRKRH		VEVSQAPLPP		APAYLSSPLA		LPSQRRSPPE		EPPDFCCPKC
QYQAPDMDTL		QIHVMECIE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Jin D.-Y., Jeang K.-T. (1999). Isolation of full-length cDNA and chromosomal localization of human NF-kappaB modulator NEMO to Xq28. J. Biomed. Sci. 6: 115—120. PMID 10087442 DOI:10.1007/BF02256442
• Rothwarf D.M., Zandi E., Natoli G., Karin M. (1998). IKK-gamma is an essential regulatory subunit of the IkappaB kinase complex. Nature. 395: 297—300. PMID 9751060 DOI:10.1038/26261
• Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jin D.-Y., Giordano V., Kibler K.V., Nakano H., Jeang K.-T. (1999). Role of adapter function in oncoprotein-mediated activation of NF-kappaB: human T-cell leukemia virus type I Tax interacts directly with IkappaB kinase gamma. J. Biol. Chem. 274: 17402—17405. PMID 10364167 DOI:10.1074/jbc.274.25.17402
• Xiao G., Sun S.C. (2000). Activation of IKKalpha and IKKbeta through their fusion with HTLV-I tax protein. Oncogene. 19: 5198—5203. PMID 11064457 DOI:10.1038/sj.onc.1203894

Див. також

• Хромосома X