NEK9

NEK9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZKE, 3ZKF
Ідентифікатори
Символи	NEK9, NERCC, NERCC1, Nek8, NIMA related kinase 9, APUG, LCCS10, NC
Зовнішні ІД	OMIM: 609798 MGI: 2387995 HomoloGene: 13222 GeneCards: NEK9
Пов'язані генетичні захворювання
NEK9-related lethal skeletal dysplasia
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • protein kinase binding • protein serine/threonine kinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • центросома Біологічний процес • фосфорилювання • поділ клітини • mitotic nuclear membrane disassembly • клітинний цикл • protein phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91754	217718
Ensembl	ENSG00000119638	ENSMUSG00000034290
UniProt	Q8TD19	Q8K1R7
RefSeq (мРНК)	NM_033116 NM_001329237 NM_001329238	NM_145138
RefSeq (білок)	NP_001316166 NP_001316167 NP_149107	NP_660120
Локус (UCSC)	Хр. 14: 75.08 – 75.13 Mb	Хр. 12: 85.35 – 85.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NEK9 (англ. NIMA related kinase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 979 амінокислот, а молекулярна маса — 107 168.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVLGEYERH		CDSINSDFGS		ESGGCGDSSP		GPSASQGPRA		GGGAAEQEEL
HYIPIRVLGR		GAFGEATLYR		RTEDDSLVVW		KEVDLTRLSE		KERRDALNEI
VILALLQHDN		IIAYYNHFMD		NTTLLIELEY		CNGGNLYDKI		LRQKDKLFEE
EMVVWYLFQI		VSAVSCIHKA		GILHRDIKTL		NIFLTKANLI		KLGDYGLAKK
LNSEYSMAET		LVGTPYYMSP		ELCQGVKYNF		KSDIWAVGCV		IFELLTLKRT
FDATNPLNLC		VKIVQGIRAM		EVDSSQYSLE		LIQMVHSCLD		QDPEQRPTAD
ELLDRPLLRK		RRREMEEKVT		LLNAPTKRPR		SSTVTEAPIA		VVTSRTSEVY
VWGGGKSTPQ		KLDVIKSGCS		ARQVCAGNTH		FAVVTVEKEL		YTWVNMQGGT
KLHGQLGHGD		KASYRQPKHV		EKLQGKAIRQ		VSCGDDFTVC		VTDEGQLYAF
GSDYYGCMGV		DKVAGPEVLE		PMQLNFFLSN		PVEQVSCGDN		HVVVLTRNKE
VYSWGCGEYG		RLGLDSEEDY		YTPQKVDVPK		ALIIVAVQCG		CDGTFLLTQS
GKVLACGLNE		FNKLGLNQCM		SGIINHEAYH		EVPYTTSFTL		AKQLSFYKIR
TIAPGKTHTA		AIDERGRLLT		FGCNKCGQLG		VGNYKKRLGI		NLLGGPLGGK
QVIRVSCGDE		FTIAATDDNH		IFAWGNGGNG		RLAMTPTERP		HGSDICTSWP
RPIFGSLHHV		PDLSCRGWHT		ILIVEKVLNS		KTIRSNSSGL		SIGTVFQSSS
PGGGGGGGGG		EEEDSQQESE		TPDPSGGFRG		TMEADRGMEG		LISPTEAMGN
SNGASSSCPG		WLRKELENAE		FIPMPDSPSP		LSAAFSESEK		DTLPYEELQG
LKVASEAPLE		HKPQVEASSP		RLNPAVTCAG		KGTPLTPPAC		ACSSLQVEVE
RLQGLVLKCL		AEQQKLQQEN		LQIFTQLQKL		NKKLEGGQQV		GMHSKGTQTA
KEEMEMDPKP		DLDSDSWCLL		GTDSCRPSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Roig J., Mikhailov A., Belham C., Avruch J. (2002). Nercc1, a mammalian NIMA-family kinase, binds the Ran GTPase and regulates mitotic progression. Genes Dev. 16: 1640—1658. PMID 12101123 DOI:10.1101/gad.972202
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tan B.C.-M., Lee S.-C. (2004). Nek9, a novel FACT-associated protein, modulates interphase progression. J. Biol. Chem. 279: 9321—9330. PMID 14660563 DOI:10.1074/jbc.M311477200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Levinsohn J.L., Sugarman J.L., McNiff J.M., Antaya R.J., Choate K.A. (2016). Somatic mutations in NEK9 cause nevus comedonicus. Am. J. Hum. Genet. 98: 1030—1037. PMID 27153399 DOI:10.1016/j.ajhg.2016.03.019
• Gallego P., Velazquez-Campoy A., Regue L., Roig J., Reverter D. (2013). Structural analysis of the regulation of the DYNLL/LC8 binding to Nek9 by phosphorylation. J. Biol. Chem. 288: 12283—12294. PMID 23482567 DOI:10.1074/jbc.M113.459149

Див. також

• Хромосома 14