PARP1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PARP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PARP1, ADPRT, ADPRT 1, ADPRT1, ARTD1, PARP, PARP-1, PPOL, pADPRT-1, poly(ADP-ribose) polymerase 1, Poly-PARP, PARS
Зовнішні ІД OMIM: 173870 MGI: 1340806 HomoloGene: 1222 GeneCards: PARP1
Пов'язані генетичні захворювання
меланома[1]
Реагує на сполуку
олапаріб, rucaparib[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001618
NM_007415
RefSeq (білок)
NP_001609
NP_001609.2
н/д
Локус (UCSC) Хр. 1: 226.36 – 226.41 Mb Хр. 1: 180.4 – 180.43 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PARP1 (англ. Poly(ADP-ribose) polymerase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 014 амінокислот, а молекулярна маса — 113 084[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAESSDKLYRVEYAKSGRASCKKCSESIPKDSLRMAIMVQSPMFDGKVPH
WYHFSCFWKVGHSIRHPDVEVDGFSELRWDDQQKVKKTAEAGGVTGKGQD
GIGSKAEKTLGDFAAEYAKSNRSTCKGCMEKIEKGQVRLSKKMVDPEKPQ
LGMIDRWYHPGCFVKNREELGFRPEYSASQLKGFSLLATEDKEALKKQLP
GVKSEGKRKGDEVDGVDEVAKKKSKKEKDKDSKLEKALKAQNDLIWNIKD
ELKKVCSTNDLKELLIFNKQQVPSGESAILDRVADGMVFGALLPCEECSG
QLVFKSDAYYCTGDVTAWTKCMVKTQTPNRKEWVTPKEFREISYLKKLKV
KKQDRIFPPETSASVAATPPPSTASAPAAVNSSASADKPLSNMKILTLGK
LSRNKDEVKAMIEKLGGKLTGTANKASLCISTKKEVEKMNKKMEEVKEAN
IRVVSEDFLQDVSASTKSLQELFLAHILSPWGAEVKAEPVEVVAPRGKSG
AALSKKSKGQVKEEGINKSEKRMKLTLKGGAAVDPDSGLEHSAHVLEKGG
KVFSATLGLVDIVKGTNSYYKLQLLEDDKENRYWIFRSWGRVGTVIGSNK
LEQMPSKEDAIEHFMKLYEEKTGNAWHSKNFTKYPKKFYPLEIDYGQDEE
AVKKLTVNPGTKSKLPKPVQDLIKMIFDVESMKKAMVEYEIDLQKMPLGK
LSKRQIQAAYSILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNRFYTLIPHDFGMKKPP
LLNNADSVQAKVEMLDNLLDIEVAYSLLRGGSDDSSKDPIDVNYEKLKTD
IKVVDRDSEEAEIIRKYVKNTHATTHNAYDLEVIDIFKIEREGECQRYKP
FKQLHNRRLLWHGSRTTNFAGILSQGLRIAPPEAPVTGYMFGKGIYFADM
VSKSANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELKHASHISKLPKGKHSVKG
LGKTTPDPSANISLDGVDVPLGTGISSGVNDTSLLYNEYIVYDIAQVNLK
YLLKLKFNFKTSLW

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Auer B., Nagl U., Herzog H., Schneider R., Schweiger M. (1989). Human nuclear NAD+ ADP-ribosyltransferase(polymerizing): organization of the gene. DNA. 8: 575—580. PMID 2513174 DOI:10.1089/dna.1989.8.575
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Maruyama T., Nara K., Yoshikawa H., Suzuki N. (2007). Txk, a member of the non-receptor tyrosine kinase of the Tec family, forms a complex with poly(ADP-ribose) polymerase 1 and elongation factor 1alpha and regulates interferon-gamma gene transcription in Th1 cells. Clin. Exp. Immunol. 147: 164—175. PMID 17177976 DOI:10.1111/j.1365-2249.2006.03249.x
  • Rolli V., O'Farrell M., Menissier-de Murcia J., de Murcia G.M. (1997). Random mutagenesis of the poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain reveals amino acids involved in polymer branching. Biochemistry. 36: 12147—12154. PMID 9315851 DOI:10.1021/bi971055p
  • Dantzer F., Nasheuer H.P., Vonesch J.L., de Murcia G., Menissier-de Murcia J. (1998). Functional association of poly(ADP-ribose) polymerase with DNA polymerase alpha-primase complex: a link between DNA strand break detection and DNA replication. Nucleic Acids Res. 26: 1891—1898. PMID 9518481 DOI:10.1093/nar/26.8.1891
  • Li Y., Oh H.J., Lau Y.-F.C. (2006). The poly(ADP-ribose) polymerase 1 interacts with Sry and modulates its biological functions. Mol. Cell. Endocrinol. 257: 35—46. PMID 16904257 DOI:10.1016/j.mce.2006.06.008

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]