PRPF4B

PRPF4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4IAN, 4IFC, 4IIR, 4IJP
Ідентифікатори
Символи	PRPF4B, PR4H, PRP4, PRP4H, PRP4K, dJ1013A10.1, pre-mRNA processing factor 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 602338 MGI: 109584 HomoloGene: 134085 GeneCards: PRPF4B
Онтологія гена Молекулярна функція • kinase activity • transferase activity • protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • хромосома • nuclear speck Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • protein phosphorylation • mRNA processing • Сплайсинг РНК • фосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8899	19134
Ensembl	ENSG00000112739	ENSMUSG00000021413
UniProt	Q13523	Q61136
RefSeq (мРНК)	NM_003913 NM_176800	NM_013830
RefSeq (білок)	NP_003904	NP_038858
Локус (UCSC)	Хр. 6: 4.02 – 4.06 Mb	Хр. 13: 34.88 – 34.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF4B (англ. Pre-mRNA processing factor 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 116 987.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAETQSLR		EQPEMEDANS		EKSINEENGE		VSEDQSQNKH		SRHKKKKHKH
RSKHKKHKHS		SEEDKDKKHK		HKHKHKKHKR		KEIIDASDKE		GMSPAKRTKL
DDLALLEDLE		KQRALIKAEL		DNELMEGKVQ		SGMGLILQGY		ESGSEEEGEI
HEKARNGNRS		STRSSSTKGK		LELVDNKITT		KKRSKSRSKE		RTRHRSDKKK
SKGGIEIVKE		KTTRSKSKER		KKSKSPSKRS		KSQDQARKSK		SPTLRRRSQE
KIGKARSPTD		DKVKIEDKSK		SKDRKKSPII		NESRSRDRGK		KSRSPVDLRG
KSKDRRSRSK		ERKSKRSETD		KEKKPIKSPS		KDASSGKENR		SPSRRPGRSP
KRRSLSPKPR		DKSRRSRSPL		LNDRRSKQSK		SPSRTLSPGR		RAKSRSLERK
RREPERRRLS		SPRTRPRDDI		LSRRERSKDA		SPINRWSPTR		RRSRSPIRRR
SRSPLRRSRS		PRRRSRSPRR		RDRGRRSRSR		LRRRSRSRGG		RRRRSRSKVK
EDKFKGSLSE		GMKVEQESSS		DDNLEDFDVE		EEDEEALIEQ		RRIQRQAIVQ
KYKYLAEDSN		MSVPSEPSSP		QSSTRTRSPS		PDDILERVAA		DVKEYERENV
DTFEASVKAK		HNLMTVEQNN		GSSQKKLLAP		DMFTESDDMF		AAYFDSARLR
AAGIGKDFKE		NPNLRDNWTD		AEGYYRVNIG		EVLDKRYNVY		GYTGQGVFSN
VVRARDNARA		NQEVAVKIIR		NNELMQKTGL		KELEFLKKLN		DADPDDKFHC
LRLFRHFYHK		QHLCLVFEPL		SMNLREVLKK		YGKDVGLHIK		AVRSYSQQLF
LALKLLKRCN		ILHADIKPDN		ILVNESKTIL		KLCDFGSASH		VADNDITPYL
VSRFYRAPEI		IIGKSYDYGI		DMWSVGCTLY		ELYTGKILFP		GKTNNHMLKL
AMDLKGKMPN		KMIRKGVFKD		QHFDQNLNFM		YIEVDKVTER		EKVTVMSTIN
PTKDLLADLI		GCQRLPEDQR		KKVHQLKDLL		DQILMLDPAK		RISINQALQH
AFIQEKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Kojima T., Zama T., Wada K., Onogi H., Hagiwara M. (2001). Cloning of human PRP4 reveals interaction with Clk1. J. Biol. Chem. 276: 32247—32256. PMID 11418604 DOI:10.1074/jbc.M103790200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 6