SIRT2

SIRT2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1J8F, 3ZGO, 3ZGV, 4L3O, 4R8M, 4RMG, 4RMH, 4RMI, 4RMJ, 4Y6O, 5DY4, 5D7O, 5DY5, 4Y6L, 4Y6Q, 4X3O, 4X3P, 5D7P, 5D7Q, 5FYQ
Ідентифікатори
Символи	SIRT2, SIR2, SIR2L, SIR2L2, sirtuin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604480 MGI: 1927664 HomoloGene: 40823 GeneCards: SIRT2
Онтологія гена Молекулярна функція • histone deacetylase binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • protein deacetylase activity • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • tubulin deacetylase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific) • NAD-dependent protein deacetylase activity • histone deacetylase activity • ubiquitin binding • NAD+ binding • beta-tubulin binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • hydrolase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • центр організації мікротрубочок • chromatin silencing complex • perinuclear region of cytoplasm • paranode region of axon • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • центросома • cell projection • myelin sheath • glial cell projection • Schmidt-Lanterman incisure • paranodal junction • перикаріон • growth cone • веретено поділу • хромосома • lateral loop • mitotic spindle • meiotic spindle • midbody • Центріоль • juxtaparanode region of axon • теломера • ядерце • мітохондрія • клітинна мембрана Біологічний процес • cellular response to molecule of bacterial origin • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process involved in cellular response to hypoxia • cellular response to epinephrine stimulus • tubulin deacetylation • rDNA heterochromatin assembly • phosphatidylinositol 3-kinase signaling • клітинний цикл • positive regulation of DNA binding • negative regulation of autophagy • cellular response to hypoxia • negative regulation of cell population proliferation • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular lipid catabolic process • histone H3 deacetylation • peptidyl-lysine deacetylation • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • substantia nigra development • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • negative regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • negative regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • myelination in peripheral nervous system • histone H4 deacetylation • regulation of myelination • вроджений імунітет • hepatocyte growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of exit from mitosis • диференціація клітин • protein ADP-ribosylation • процес імунної системи • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • regulation of phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • response to redox state • protein deacetylation • positive regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore • GO:0007126 мейоз • cellular response to caloric restriction • ripoptosome assembly involved in necroptotic process • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of defense response to bacterium • positive regulation of execution phase of apoptosis • protein kinase B signaling • negative regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of oocyte maturation • regulation of cell cycle • поділ клітини • автофагія • positive regulation of meiotic nuclear division • cellular response to oxidative stress • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • histone deacetylation • positive regulation of cell division • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22933	64383
Ensembl	ENSG00000283100 ENSG00000068903	ENSMUSG00000015149
UniProt	Q8IXJ6	Q8VDQ8
RefSeq (мРНК)	NM_001193286 NM_012237 NM_030593	NM_001122765 NM_001122766 NM_022432
RefSeq (білок)	NP_001180215 NP_036369 NP_085096	NP_001116237 NP_001116238 NP_071877
Локус (UCSC)	Хр. 19: 38.88 – 38.9 Mb	Хр. 7: 28.47 – 28.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIRT2 (англ. Sirtuin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 43 182.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPDPSHPL		ETQAGKVQEA		QDSDSDSEGG		AAGGEADMDF		LRNLFSQTLS
LGSQKERLLD		ELTLEGVARY		MQSERCRRVI		CLVGAGISTS		AGIPDFRSPS
TGLYDNLEKY		HLPYPEAIFE		ISYFKKHPEP		FFALAKELYP		GQFKPTICHY
FMRLLKDKGL		LLRCYTQNID		TLERIAGLEQ		EDLVEAHGTF		YTSHCVSASC
RHEYPLSWMK		EKIFSEVTPK		CEDCQSLVKP		DIVFFGESLP		ARFFSCMQSD
FLKVDLLLVM		GTSLQVQPFA		SLISKAPLST		PRLLINKEKA		GQSDPFLGMI
MGLGGGMDFD		SKKAYRDVAW		LGECDQGCLA		LAELLGWKKE		LEDLVRREHA
SIDAQSGAGV		PNPSTSASPK		KSPPPAKDEA		RTTEREKPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, автофагія, диференціація клітин, нейрогенез, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках, хромосомах.

Література

• Frye R.A. (1999). Characterization of five human cDNAs with homology to the yeast SIR2 gene: Sir2-like proteins (sirtuins) metabolize NAD and may have protein ADP-ribosyltransferase activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 273—279. PMID 10381378 DOI:10.1006/bbrc.1999.0897
• Afshar G., Murnane J.P. (1999). Characterization of a human gene with sequence homology to Saccharomyces cerevisiae SIR2. Gene. 234: 161—168. PMID 10393250 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00162-6
• Rack J.G., Vanlinden M.R., Lutter T., Aasland R., Ziegler M. (2014). Constitutive nuclear localization of an alternatively spliced sirtuin-2 isoform. J. Mol. Biol. 426: 1677—1691. PMID 24177535 DOI:10.1016/j.jmb.2013.10.027
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Grozinger C.M., Chao E.D., Blackwell H.E., Moazed D., Schreiber S.L. (2001). Identification of a class of small molecule inhibitors of the sirtuin family of NAD-dependent deacetylases by phenotypic screening. J. Biol. Chem. 276: 38837—38843. PMID 11483616 DOI:10.1074/jbc.M106779200
• North B.J., Marshall B.L., Borra M.T., Denu J.M., Verdin E. (2003). The human Sir2 ortholog, SIRT2, is an NAD+-dependent tubulin deacetylase. Mol. Cell. 11: 437—444. PMID 12620231 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00038-8

Див. також

• Хромосома 19