SMARCA1

SMARCA1
Ідентифікатори
Символи	SMARCA1, ISWI, NURF140, SNF2L, SNF2L1, SNF2LB, SNF2LT, SWI, SWI2, hSNF2L, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 300012 MGI: 1935127 HomoloGene: 55711 GeneCards: SMARCA1
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP-dependent DNA/DNA annealing activity • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0008026 helicase activity • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • nucleosome binding • hydrolase activity • ATP binding • transcription factor binding • ATPase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • CERF complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • NURF complex Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • brain development • neuron differentiation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6594	93761
Ensembl	ENSG00000102038	ENSMUSG00000031099
UniProt	P28370	Q6PGB8
RefSeq (мРНК)	NM_001282874 NM_001282875 NM_003069 NM_139035 NM_001378261 NM_001378262 NM_001378263 NM_001378264	NM_001290708 NM_053123 NM_001358618 NM_001358619
RefSeq (білок)	NP_001269803 NP_001269804 NP_003060 NP_001365190 NP_001365191 NP_001365192 NP_001365193	NP_001277637 NP_444353 NP_001345547 NP_001345548
Локус (UCSC)	Хр. X: 129.45 – 129.52 Mb	Хр. X: 46.9 – 46.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMARCA1 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 054 амінокислот, а молекулярна маса — 122 605.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQDTAAVAA		TVAAADATAT		IVVIEDEQPG		PSTSQEEGAA		AAATEATAAT
EKGEKKKEKN		VSSFQLKLAA		KAPKSEKEMD		PEYEEKMKAD		RAKRFEFLLK
QTELFAHFIQ		PSAQKSPTSP		LNMKLGRPRI		KKDEKQSLIS		AGDYRHRRTE
QEEDEELLSE		SRKTSNVCIR		FEVSPSYVKG		GPLRDYQIRG		LNWLISLYEN
GVNGILADEM		GLGKTLQTIA		LLGYLKHYRN		IPGPHMVLVP		KSTLHNWMNE
FKRWVPSLRV		ICFVGDKDAR		AAFIRDEMMP		GEWDVCVTSY		EMVIKEKSVF
KKFHWRYLVI		DEAHRIKNEK		SKLSEIVREF		KSTNRLLLTG		TPLQNNLHEL
WALLNFLLPD		VFNSADDFDS		WFDTKNCLGD		QKLVERLHAV		LKPFLLRRIK
TDVEKSLPPK		KEIKIYLGLS		KMQREWYTKI		LMKDIDVLNS		SGKMDKMRLL
NILMQLRKCC		NHPYLFDGAE		PGPPYTTDEH		IVSNSGKMVV		LDKLLAKLKE
QGSRVLIFSQ		MTRLLDILED		YCMWRGYEYC		RLDGQTPHEE		REDKFLEVEF
LGQREAIEAF		NAPNSSKFIF		MLSTRAGGLG		INLASADVVI		LYDSDWNPQV
DLQAMDRAHR		IGQKKPVRVF		RLITDNTVEE		RIVERAEIKL		RLDSIVIQQG
RLIDQQSNKL		AKEEMLQMIR		HGATHVFASK		ESELTDEDIT		TILERGEKKT
AEMNERLQKM		GESSLRNFRM		DIEQSLYKFE		GEDYREKQKL		GMVEWIEPPK
RERKANYAVD		AYFREALRVS		EPKIPKAPRP		PKQPNVQDFQ		FFPPRLFELL
EKEILYYRKT		IGYKVPRNPD		IPNPALAQRE		EQKKIDGAEP		LTPEETEEKE
KLLTQGFTNW		TKRDFNQFIK		ANEKYGRDDI		DNIAREVEGK		SPEEVMEYSA
VFWERCNELQ		DIEKIMAQIE		RGEARIQRRI		SIKKALDAKI		ARYKAPFHQL
RIQYGTSKGK		NYTEEEDRFL		ICMLHKMGFD		RENVYEELRQ		CVRNAPQFRF
DWFIKSRTAM		EFQRRCNTLI		SLIEKENMEI		EERERAEKKK		RATKTPMVKF
SAFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Barak O., Lazzaro M.A., Cooch N.S., Picketts D.J., Shiekhattar R. (2004). A tissue-specific, naturally occurring human SNF2L variant inactivates chromatin remodeling. J. Biol. Chem. 279: 45130—45138. PMID 15310751 doi:10.1074/jbc.M406212200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X