SPATA2

SPATA2
Ідентифікатори
Символи	SPATA2, PD1, PPP1R145, tamo, spermatogenesis associated 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607662 MGI: 2146885 HomoloGene: 4407 GeneCards: SPATA2
Пов'язані генетичні захворювання
Псоріаз
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • fibrillar center Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • Сперматогенез • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of inflammatory response • regulation of necroptotic process • protein K63-linked deubiquitination • protein linear deubiquitination • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9825	263876
Ensembl	ENSG00000158480	ENSMUSG00000047030
UniProt	Q9UM82	Q8K004
RefSeq (мРНК)	NM_001135773 NM_006038	NM_170756 NM_001356523
RefSeq (білок)	NP_001129245 NP_006029	NP_001343452 NP_739562
Локус (UCSC)	Хр. 20: 49.9 – 49.92 Mb	Хр. 2: 167.32 – 167.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPATA2 (англ. Spermatogenesis associated 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 58 427.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKPSSMDTK		FKDDLFRKYV		QFHESKVDTT		TSRQRPGSDE		CLRVAASTLL
SLHKVDPFYR		FRLIQFYEVV		ESSLRSLSSS		SLRALHGAFS		MLETVGINLF
LYPWKKEFRS		IKTYTGPFVY		YVKSTLLEED		IRAILSCMGY		TPELGTAYKL
RELVETLQVK		MVSFELFLAK		VECEQMLEIH		SQVKDKGYSE		LDIVSERKSS
AEDVRGCSDA		LRRRAEGREH		LTASMSRVAL		QKSASERAAK		DYYKPRVTKP
SRSVDAYDSY		WESRKPPLKA		SLSLRKEPVA		TDVGDDLKDE		IIRPSPSLLT
MASSPHGSPD		VLPPASPSNG		PALLRGTYFS		TQDDVDLYTD		SEPRATYRRQ
DALRPDVWLL		RNDAHSLYHK		RSPPAKESAL		SKCQSCGLSC		SSSLCQRCDS
LLTCPPASKP		SAFPSKASTH		DSLAHGASLR		EKYPGQTQGL		DRLPHLHSKS
KPSTTPTSRC		GFCNRPGATN		TCTQCSKVSC		DACLSAYHYD		PCYKKSELHK
FMPNNQLNYK		STQLSHLVYR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20