SRCAP

SRCAP
Ідентифікатори
Символи	SRCAP, DOMO1, EAF1, FLHS, SWR1, Snf2-related CREBBP activator protein, Snf2 related CREBBP activator protein, DEHMBA
Зовнішні ІД	OMIM: 611421 MGI: 2444036 HomoloGene: 38213 GeneCards: SRCAP
Пов'язані генетичні захворювання
Floating-Harbor syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • hydrolase activity • GO:0008026 helicase activity • histone acetyltransferase activity • ATPase activity • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • Нуклеоплазма • Ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex • Swr1 complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • ремоделювання хроматину • GO:0035042 histone exchange Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10847	100043597
Ensembl	ENSG00000080603	ENSMUSG00000053877
UniProt	Q6ZRS2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_006662	NM_001033881 NM_001304266 NM_175144 NM_178800
RefSeq (білок)	NP_006653	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 30.7 – 30.74 Mb	Хр. 7: 127.11 – 127.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRCAP (англ. Snf2 related CREBBP activator protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 230 амінокислот, а молекулярна маса — 343 555.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSSPSPAHP		QLPVLQTQMV		SDGMTGSNPV		SPASSSSPAS		SGAGGISPQH
IAQDSSLDGP		PGPPDGATVP		LEGFSLSQAA		DLANKGPKWE		KSHAEIAEQA
KHEAEIETRI		AELRKEGFWS		LKRLPKVPEP		PRPKGHWDYL		CEEMQWLSAD
FAQERRWKRG		VARKVVRMVI		RHHEEQRQKE		ERARREEQAK		LRRIASTMAK
DVRQFWSNVE		KVVQFKQQSR		LEEKRKKALD		LHLDFIVGQT		EKYSDLLSQS
LNQPLTSSKA		GSSPCLGSSS		AASSPPPPAS		RLDDEDGDFQ		PQEDEEEDDE
ETIEVEEQQE		GNDAEAQRRE		IELLRREGEL		PLEELLRSLP		PQLLEGPSSP
SQTPSSHDSD		TRDGPEEGAE		EEPPQVLEIK		PPPSAVTQRN		KQPWHPDEDD
EEFTANEEEA		EDEEDTIAAE		EQLEGEVDHA		MELSELAREG		ELSMEELLQQ
YAGAYAPGSG		SSEDEDEDEV		DANSSDCEPE		GPVEAEEPPQ		EDSSSQSDSV
EDRSEDEEDE		HSEEEETSGS		SASEESESEE		SEDAQSQSQA		DEEEEDDDFG
VEYLLARDEE		QSEADAGSGP		PTPGPTTLGP		KKEITDIAAA		AESLQPKGYT
LATTQVKTPI		PLLLRGQLRE		YQHIGLDWLV		TMYEKKLNGI		LADEMGLGKT
IQTISLLAHL		ACEKGNWGPH		LIIVPTSVML		NWEMELKRWC		PSFKILTYYG
AQKERKLKRQ		GWTKPNAFHV		CITSYKLVLQ		DHQAFRRKNW		RYLILDEAQN
IKNFKSQRWQ		SLLNFNSQRR		LLLTGTPLQN		SLMELWSLMH		FLMPHVFQSH
REFKEWFSNP		LTGMIEGSQE		YNEGLVKRLH		KVLRPFLLRR		VKVDVEKQMP
KKYEHVIRCR		LSKRQRCLYD		DFMAQTTTKE		TLATGHFMSV		INILMQLRKV
CNHPNLFDPR		PVTSPFITPG		ICFSTASLVL		RATDVHPLQR		IDMGRFDLIG
LEGRVSRYEA		DTFLPRHRLS		RRVLLEVATA		PDPPPRPKPV		KMKVNRMLQP
VPKQEGRTVV		VVNNPRAPLG		PVPVRPPPGP		ELSAQPTPGP		VPQVLPASLM
VSASPAGPPL		IPASRPPGPV		LLPPLQPNSG		SLPQVLPSPL		GVLSGTSRPP
TPTLSLKPTP		PAPVRLSPAP		PPGSSSLLKP		LTVPPGYTFP		PAAATTTSTT
TATATTTAVP		APTPAPQRLI		LSPDMQARLP		SGEVVSIGQL		ASLAQRPVAN
AGGSKPLTFQ		IQGNKLTLTG		AQVRQLAVGQ		PRPLQRNVVH		LVSAGGQHHL
ISQPAHVALI		QAVAPTPGPT		PVSVLPSSTP		STTPAPTGLS		LPLAANQVPP
TMVNNTGVVK		IVVRQAPRDG		LTPVPPLAPA		PRPPSSGLPA		VLNPRPTLTP
GRLPTPTLGT		ARAPMPTPTL		VRPLLKLVHS		PSPEVSASAP		GAAPLTISSP
LHVPSSLPGP		ASSPMPIPNS		SPLASPVSST		VSVPLSSSLP		ISVPTTLPAP
ASAPLTIPIS		APLTVSASGP		ALLTSVTPPL		APVVPAAPGP		PSLAPSGASP
SASALTLGLA		TAPSLSSSQT		PGHPLLLAPT		SSHVPGLNST		VAPACSPVLV
PASALASPFP		SAPNPAPAQA		SLLAPASSAS		QALATPLAPM		AAPQTAILAP
SPAPPLAPLP		VLAPSPGAAP		VLASSQTPVP		VMAPSSTPGT		SLASASPVPA
PTPVLAPSST		QTMLPAPVPS		PLPSPASTQT		LALAPALAPT		LGGSSPSQTL
SLGTGNPQGP		FPTQTLSLTP		ASSLVPTPAQ		TLSLAPGPPL		GPTQTLSLAP
APPLAPASPV		GPAPAHTLTL		APASSSASLL		APASVQTLTL		SPAPVPTLGP
AAAQTLALAP		ASTQSPASQA		SSLVVSASGA		APLPVTMVSR		LPVSKDEPDT
LTLRSGPPSP		PSTATSFGGP		RPRRQPPPPP		RSPFYLDSLE		EKRKRQRSER
LERIFQLSEA		HGALAPVYGT		EVLDFCTLPQ		PVASPIGPRS		PGPSHPTFWT
YTEAAHRAVL		FPQQRLDQLS		EIIERFIFVM		PPVEAPPPSL		HACHPPPWLA
PRQAAFQEQL		ASELWPRARP		LHRIVCNMRT		QFPDLRLIQY		DCGKLQTLAV
LLRQLKAEGH		RVLIFTQMTR		MLDVLEQFLT		YHGHLYLRLD		GSTRVEQRQA
LMERFNADKR		IFCFILSTRS		GGVGVNLTGA		DTVVFYDSDW		NPTMDAQAQD
RCHRIGQTRD		VHIYRLISER		TVEENILKKA		NQKRMLGDMA		IEGGNFTTAY
FKQQTIRELF		DMPLEEPSSS		SVPSAPEEEE		ETVASKQTHI		LEQALCRAED
EEDIRAATQA		KAEQVAELAE		FNENDGFPAG		EGEEAGRPGA		EDEEMSRAEQ
EIAALVEQLT		PIERYAMKFL		EASLEEVSRE		ELKQAEEQVE		AARKDLDQAK
EEVFRLPQEE		EEGPGAGDES		SCGTGGGTHR		RSKKAKAPER		PGTRVSERLR
GARAETQGAN		HTPVISAHQT		RSTTTPPRCS		PARERVPRPA		PRPRPTPASA
PAAIPALVPV		PVSAPVPISA		PNPITILPVH		ILPSPPPPSQ		IPPCSSPACT
PPPACTPPPA		HTPPPAQTCL		VTPSSPLLLG		PPSVPISASV		TNLPLGLRPE
AELCAQALAS		PESLELASVA		SSETSSLSLV		PPKDLLPVAV		EILPVSEKNL
SLTPSAPSLT		LEAGSIPNGQ		EQEAPDSAEG		TTLTVLPEGE		ELPLCVSESN
GLELPPSAAS		DEPLQEPLEA		DRTSEELTEA		KTPTSSPEKP		QELVTAEVAA
PSTSSSATSS		PEGPSPARPP		RRRTSADVEI		RGQGTGRPGQ		PPGPKVLRKL
PGRLVTVVEE		KELVRRRRQQ		RGAASTLVPG		VSETSASPGS		PSVRSMSGPE
SSPPIGGPCE		AAPSSSLPTP		PQQPFIARRH		IELGVTGGGS		PENGDGALLA
ITPPAVKRRR		GRPPKKNRSP		ADAGRGVDEA		PSSTLKGKTN		GADPVPGPET
LIVADPVLEP		QLIPGPQPLG		PQPVHRPNPL		LSPVEKRRRG		RPPKARDLPI
PGTISSAGDG		NSESRTQPPP		HPSPLTPLPP		LLVCPTATVA		NTVTTVTIST
SPPKRKRGRP		PKNPPSPRPS		QLPVLDRDST		SVLESCGLGR		RRQPQGQGES
EGSSSDEDGS		RPLTRLARLR		LEAEGMRGRK		SGGSMVVAVI		QDDLDLADSG
PGGLELTPPV		VSLTPKLRST		RLRPGSLVPP		LETEKLPRKR		AGAPVGGSPG
LAKRGRLQPP		SPLGPEGSVE		ESEAEASGEE		EEGDGTPRRR		PGPRRLVGTT
NQGDQRILRS		SAPPSLAGPA		VSHRGRKAKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Johnston H., Kneer J., Chackalaparampil I., Yaciuk P., Chrivia J. (1999). Identification of a novel SNF2/SWI2 protein family member, SRCAP, which interacts with CREB-binding protein. J. Biol. Chem. 274: 16370—16376. PMID 10347196 DOI:10.1074/jbc.274.23.16370
• Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004
• Eissenberg J.C., Wong M., Chrivia J.C. (2005). Human SRCAP and Drosophila melanogaster DOM are homologs that function in the notch signaling pathway. Mol. Cell. Biol. 25: 6559—6569. PMID 16024792 DOI:10.1128/MCB.25.15.6559-6569.2005
• Wong M.M., Cox L.K., Chrivia J.C. (2007). The chromatin remodeling protein, SRCAP, is critical for deposition of the histone variant H2A.Z at promoters. J. Biol. Chem. 282: 26132—26139. PMID 17617668 DOI:10.1074/jbc.M703418200

Див. також

• Хромосома 16