CDK13

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CDK13
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CDK13, CDC2L, CDC2L5, CHED, hcyclin-dependent kinase 13, cyclin dependent kinase 13, CHDFIDD
Зовнішні ІД OMIM: 603309 MGI: 1916812 HomoloGene: 135707 GeneCards: CDK13
Пов'язані генетичні захворювання
Congenital heart defects, dysmorphic facial features, and intellectual developmental disorder, syndromic intellectual disability[1]
Реагує на сполуку
at-7519, AZD5438[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_003718
NM_031267
NM_001081058
NM_027118
RefSeq (білок)
NP_003709
NP_112557
NP_001074527
NP_081394
Локус (UCSC) Хр. 7: 39.95 – 40.1 Mb Хр. 13: 17.88 – 17.98 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDK13 (англ. Cyclin dependent kinase 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 512 амінокислот, а молекулярна маса — 164 923[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQ
PPPPPPPLLFLAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAG
GRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVS
SQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR
DRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGS
SSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSP
YSRRLPRSPSPYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYS
PVLRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLA
AELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAAEAAAKAAKASNTSTPTKGNT
ETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVEN
NLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLP
LPPELPGGDDLSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKR
CVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAI
REIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMG
LLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQ
IKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTM
KPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRD
VEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLG
LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPGQHLNHSELAILLNLLQ
SKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGEKQTDPSTPQQ
ESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPD
RPRILPPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKA
ALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYV
SNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESF
PSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPEST
HPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
STGRGRGRGLPY

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]