CIITA

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CIITA
Ідентифікатори
Символи CIITA, C2TA, CIITAIV, MHC2TA, NLRA, class II, major histocompatibility complex, transactivator, class II major histocompatibility complex transactivator
Зовнішні ІД OMIM: 600005 MGI: 108445 HomoloGene: 207 GeneCards: CIITA
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт, bare lymphocyte syndrome 2[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001243760
NM_001243761
NM_007575
NM_001302618
NM_001302619
RefSeq (білок)
NP_001230689
NP_001230690
NP_001289547
NP_001289548
NP_031601
Локус (UCSC) Хр. 16: 10.87 – 10.94 Mb Хр. 16: 10.3 – 10.35 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CIITA (англ. Class II major histocompatibility complex transactivator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 123 514[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRCLAPRPAGSYLSEPQGSSQCATMELGPLEGGYLELLNSDADPLCLYHF
YDQMDLAGEEEIELYSEPDTDTINCDQFSRLLCDMEGDEETREAYANIAE
LDQYVFQDSQLEGLSKDIFKHIGPDEVIGESMEMPAEVGQKSQKRPFPEE
LPADLKHWKPAEPPTVVTGSLLVRPVSDCSTLPCLPLPALFNQEPASGQM
RLEKTDQIPMPFSSSSLSCLNLPEGPIQFVPTISTLPHGLWQISEAGTGV
SSIFIYHGEVPQASQVPPPSGFTVHGLPTSPDRPGSTSPFAPSATDLPSM
PEPALTSRANMTEHKTSPTQCPAAGEVSNKLPKWPEPVEQFYRSLQDTYG
AEPAGPDGILVEVDLVQARLERSSSKSLERELATPDWAERQLAQGGLAEV
LLAAKEHRRPRETRVIAVLGKAGQGKSYWAGAVSRAWACGRLPQYDFVFS
VPCHCLNRPGDAYGLQDLLFSLGPQPLVAADEVFSHILKRPDRVLLILDG
FEELEAQDGFLHSTCGPAPAEPCSLRGLLAGLFQKKLLRGCTLLLTARPR
GRLVQSLSKADALFELSGFSMEQAQAYVMRYFESSGMTEHQDRALTLLRD
RPLLLSHSHSPTLCRAVCQLSEALLELGEDAKLPSTLTGLYVGLLGRAAL
DSPPGALAELAKLAWELGRRHQSTLQEDQFPSADVRTWAMAKGLVQHPPR
AAESELAFPSFLLQCFLGALWLALSGEIKDKELPQYLALTPRKKRPYDNW
LEGVPRFLAGLIFQPPARCLGALLGPSAAASVDRKQKVLARYLKRLQPGT
LRARQLLELLHCAHEAEEAGIWQHVVQELPGRLSFLGTRLTPPDAHVLGK
ALEAAGQDFSLDLRSTGICPSGLGSLVGLSCVTRFRAALSDTVALWESLQ
QHGETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKDVEDLGKLVQTQRTRSSSEDTAGE
LPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVRILTAFSSLQHLDLDALSENKIG
DEGVSQLSATFPQLKSLETLNLSQNNITDLGAYKLAEALPSLAASLLRLS
LYNNCICDVGAESLARVLPDMVSLRVMDVQYNKFTAAGAQQLAASLRRCP
HVETLAMWTPTIPFSVQEHLQQQDSRISLR

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, активаторів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Steimle V., Otten L.A., Zufferey M., Mach B. (1993). Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency (or bare lymphocyte syndrome). Cell. 75: 135—146. PMID 8402893 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80090-X
  • Riley J.L., Westerheide S.D., Price J.A., Brown J.A., Boss J.M. (1995). Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator (CIITA). Immunity. 2: 533—543. PMID 7749984 DOI:10.1016/1074-7613(95)90033-0
  • Day N.E., Ugai H., Yokoyama K.K., Ichiki A.T. (2003). K-562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region. Leuk. Res. 27: 1027—1038. PMID 12859996 DOI:10.1016/S0145-2126(03)00072-9
  • Harton J.A., Cressman D.E., Chin K.C., Der C.J., Ting J.P. (1999). GTP binding by class II transactivator: role in nuclear import. Science. 285: 1402—1405. PMID 10464099 DOI:10.1126/science.285.5432.1402
  • Soe K.C., Devaiah B.N., Singer D.S. (2013). Transcriptional coactivator CIITA, a functional homolog of TAF1, has kinase activity. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 1184—1190. PMID 24036077 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.09.001
  • Quan V., Towey M., Sacks S., Kelly A.P. (1999). Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA. Immunogenetics. 49: 957—963. PMID 10501838 DOI:10.1007/s002510050579

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7067 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P33076 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]