RACK1

RACK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AOW, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX
Ідентифікатори
Символи	RACK1, Gnb2-rs1, H12.3, HLC-7, PIG21, GNB2L1, receptor for activated C kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 176981 MGI: 101849 HomoloGene: 4446 GeneCards: RACK1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • receptor tyrosine kinase binding • SH2 domain binding • signaling adaptor activity • protein tyrosine kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • GO:0032947 molecular adaptor activity • protein phosphatase binding • signaling receptor binding • ion channel inhibitor activity • RNA binding • cadherin binding • ribosome binding • protein kinase C binding • cyclin binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • перикаріон • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • midbody • мітохондрія • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • phagocytic cup • екзосома • клітинне ядро • IRE1-RACK1-PP2A complex • нуклеоплазма • гіалоплазма • рибосома • small ribosomal subunit • cytosolic small ribosomal subunit Біологічний процес • positive regulation of protein homooligomerization • positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport • negative regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of ceramide biosynthetic process • regulation of cell division • negative regulation of phagocytosis • positive regulation of gastrulation • ритмічний процес • positive regulation of cell migration • negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response • cellular response to growth factor stimulus • negative regulation of Wnt signaling pathway • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • negative regulation of gene expression • regulation of cell cycle • regulation of protein localization • multicellular organism development • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of hydrogen peroxide-induced neuron death • positive regulation of mitochondrial depolarization • гаструляція • negative regulation of cell growth • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation • positive regulation of apoptotic process • клітинний цикл • regulation of growth • GO:0022415 viral process • regulation of establishment of cell polarity • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of translation • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular response to glucose stimulus • positive regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of protein tyrosine kinase activity • Біосинтез білків • pigmentation • Убіквітин-залежний протеоліз • rescue of stalled ribosome • negative regulation of translation • regulation of protein localization to plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10399	14694
Ensembl	ENSG00000204628	ENSMUSG00000020372
UniProt	P63244	P68040
RefSeq (мРНК)	NM_006098	NM_008143
RefSeq (білок)	NP_006089	NP_032169
Локус (UCSC)	Хр. 5: 181.24 – 181.25 Mb	Хр. 11: 48.69 – 48.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RACK1 (англ. Receptor for activated C kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 077.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEQMTLRGT		LKGHNGWVTQ		IATTPQFPDM		ILSASRDKTI		IMWKLTRDET
NYGIPQRALR		GHSHFVSDVV		ISSDGQFALS		GSWDGTLRLW		DLTTGTTTRR
FVGHTKDVLS		VAFSSDNRQI		VSGSRDKTIK		LWNTLGVCKY		TVQDESHSEW
VSCVRFSPNS		SNPIIVSCGW		DKLVKVWNLA		NCKLKTNHIG		HTGYLNTVTV
SPDGSLCASG		GKDGQAMLWD		LNEGKHLYTL		DGGDIINALC		FSPNRYWLCA
ATGPSIKIWD		LEGKIIVDEL		KQEVISTSSK		AEPPQCTSLA		WSADGQTLFA
GYTDNLVRVW		QVTIGTR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, біологічні ритми, регуляція росту, гаструляція. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Guillemot F., Billault A., Auffray C. (1989). Physical linkage of a guanine nucleotide-binding protein-related gene to the chicken major histocompatibility complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 4594—4598. PMID 2499885 DOI:10.1073/pnas.86.12.4594
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chang B.Y., Conroy K.B., Machleder E.M., Cartwright C.A. (1998). RACK1, a receptor for activated C kinase and a homolog of the beta subunit of G proteins, inhibits activity of src tyrosine kinases and growth of NIH 3T3 cells. Mol. Cell. Biol. 18: 3245—3256. PMID 9584165 DOI:10.1128/MCB.18.6.3245
• Chang B.Y., Chiang M., Cartwright C.A. (2001). The interaction of Src and RACK1 is enhanced by activation of protein kinase C and tyrosine phosphorylation of RACK1. J. Biol. Chem. 276: 20346—20356. PMID 11279199 DOI:10.1074/jbc.M101375200
• Gallina A., Rossi F., Milanesi G. (2001). Rack1 binds HIV-1 Nef and can act as a Nef-protein kinase C adaptor. Virology. 283: 7—18. PMID 11312657 DOI:10.1006/viro.2001.0855
• Liedtke C.M., Yun C.H.C., Kyle N., Wang D. (2002). Protein kinase C epsilon-dependent regulation of cystic fibrosis transmembrane regulator involves binding to a receptor for activated C kinase (RACK1) and RACK1 binding to Na+/H+ exchange regulatory factor. J. Biol. Chem. 277: 22925—22933. PMID 11956211 DOI:10.1074/jbc.M201917200

Див. також

• Хромосома 5